蛋白質序列設計和主鏈摺疊設計

《蛋白質序列設計和主鏈摺疊設計》是依託中國科學技術大學,由劉海燕擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:蛋白質序列設計和主鏈摺疊設計
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:劉海燕
  • 依託單位:中國科學技術大學
  • 批准號:31570719
  • 申請代碼:C0504
  • 負責人職稱:教授
  • 研究期限:2016-01-01 至 2019-12-31
  • 支持經費:62(萬元)
中文摘要
人工設計蛋白質是深入認識蛋白質序列結構規律的新途徑,也能為基於合理設計的蛋白質工程提供工具。蛋白質設計可分為兩個層次:以給定主鏈摺疊為目標設計胺基酸序列和從頭設計有高”可設計性“的主鏈摺疊。這裡“可設計性”是指能夠穩定摺疊成給定主鏈結構的胺基酸序列確實存在。對主鏈摺疊“可設計性”的實驗驗證依賴於高成功率的胺基酸序列設計方法。我們在前期研究中建立了胺基酸序列設計方法,並進行了實驗驗證。本項目將在對全自動序列設計進一步完善的基礎上,採用鏈生長抽樣、多尺度模型等技術,發展能設計蛋白質主鏈摺疊的模擬技術;以天然蛋白質結構數據為依據,基於貝葉斯理論建立”可設計性“的評價函式。最後,以人工構建的主鏈摺疊為目標結構進行胺基酸序列設計,獲得主鏈摺疊和胺基酸序列均為人工設計的新蛋白。

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