《蛋白功能環區組合肽庫的計算機模擬，篩選和分子設計》是李維忠為項目負責人，北京大學為依託單位的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：蛋白功能環區組合肽庫的計算機模擬，篩選和分子設計
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：李維忠
- 依託單位：北京大學
- 批准號： 29703001
- 申請代碼： B0305
- 負責人職稱： 講師
- 研究期限： 1998-01-01 至 2000-12-31
- 支持經費：11（萬元）
項目摘要
改變蛋白環區序列是功能蛋白質設計的重要方法。本課題運用自己建立的環區資料庫的最新統計結果，憑藉我們精確快速的環區構象計算程式和基於微擾突變的側鏈遺傳算法，將分子對接算法與組合化學策略結合，提出了用計算機模擬篩選組合肽庫以獲得功能蛋白的合理方法。其優勢是將蛋白質主鏈和側鏈計算分離，將側鏈計算一分子對接結合，從而反巨大組合數量的構象和結接計算簡化為少量正則構象的計算。同時，通過改時側鏈算法，對特定摺疊模式的骨架結構進行了序列的全新設計研究，獲得了設計的基本思路。本課題的主要創新之處在於將組合化學概念的多樣性與蛋白質環區構象家族分類的有限性結合起來，使計算機模擬組合肽庫這樣複雜的體系成為可能。
