《功能結構域相互作用分析與基因突變性質的研究》是依託南京大學,由王亞平擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:功能結構域相互作用分析與基因突變性質的研究
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:王亞平
- 依託單位:南京大學
- 負責人職稱:教授
- 申請代碼:H0419
- 研究期限:2005-01-01 至 2007-12-31
- 批准號:30470959
- 支持經費:22(萬元)
《功能結構域相互作用分析與基因突變性質的研究》是依託南京大學,由王亞平擔任項目負責人的面上項目。
《功能結構域相互作用分析與基因突變性質的研究》是依託南京大學,由王亞平擔任項目負責人的面上項目。項目摘要作為基因組醫學的重要標誌,遺傳性疾病的基因分析逐步成為臨床醫學的常規手段。目前基因突變分析技術已較為成熟,但對於檢出...
《鈣調神經磷酸酶的基因突變及其結構功能的研究》是依託北京師範大學,由魏群擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 擬進行鈣調神經磷酸酶關鍵部位的基因突變,結構域的基因剪下,並通過其構象、活性、功能等改變和計算機模擬等找出酶與抑制藥物作用的關鍵胺基酸,分析某些胺基酸在結構轉換和在激活、抑制中的作用,進行酶...
而對負責轉運CagA蛋白的IV型分泌裝置蛋白功能和結構域的研究較少,其轉運機制也尚未闡明。本研究擬通過採用酵母雙雜交技術、GST沉降實驗及免疫共沉澱實驗(IP)技術、基因突變和基因敲除技術、原核細胞表達技術研究幽門螺桿菌Cag致病島IV型分泌裝置轉運的分子機制,闡明幽門螺桿菌Cag-PAI 編碼的IV型分泌裝置的裝配形成...
功能域預測顯示,Sop1和Sop2可能分別參與核小體組裝和組蛋白及其它蛋白的核內外轉運。我們將主要針對這兩個基因,通過純化蛋白複合物、複合物功能分析以及遺傳和生化方法,研究它們對染色質結構、DNA損傷應答和修復等方面的影響。這些結果將有助於從染色質水平解析裂殖酵母中DNA損傷和修復的調控網路。結題摘要 DNA甲基...
弱休眠的ap2△R2不能恢復子強休眠的ABA相關突變體表型,暗示AP2可能通過ABA通路調節種子休眠。今後的研究將重點進行AP2R2結構域缺失調節的靶基因驗證和遺傳生化分析,並結合ABA相關突變體,深入研究AP2在種子發育和休眠中的功能。在本項目資助下發表文章4篇,培養博士生1名,碩士生3名。
去除BRCA1的N末端將會導致近98%的BRCA1失去與RNA合成酶的聯繫,因此認為BRCA1的N末端在調節RNA合成酶功能方面起著重要作用。基因突變 影響 如果BRCA1/2基因的結構發生了某些改變,那么它所具有的抑制腫瘤發生的功能就會受影響。2013年已發現的BRCA1/2的突變有數百種之多。有人總結了BRCA1和BRCA2基因突變相關的...
第4章基因信息的翻譯/74 4.1遺傳密碼74 4.2tRNA的結構和功能77 4.3原核生物中蛋白質的合成79 4.3.1密碼子與反密碼子的相互作用79 4.3.2蛋白質合成的過程81 4.4真核生物中的蛋白質合成84 4.5翻譯的調控機制和翻譯後的加工87 中篇基因的克隆及其功能分析 第5章DNA的克隆/92 5.1DNA克隆的載體93 5....
對Fas胞漿區胺基酸序列的比較發現,它與TNFRI有一段68aa的同源序列,這段序列對Fas和TNFRI所介導的細胞凋亡起著決定性的作用,用基因突變的方法將同源區進行改造後,它們就喪失了致凋亡的能力,所以這一同源區被命名為死亡結構域。以後的研究發現,死亡結構域也存在於其它死亡受體以及一些胞漿內信號轉導蛋白,受體...
鑑定T3SS各組分間的蛋白相互作用,將有助於闡明耶爾森菌注射小體的結構和功能。本研究將通過採用酵母雙雜交陣列篩選技術,研究鼠疫菌T3SS內部蛋白間的相互作用。鼠疫菌pCD1質粒編碼基因中,除去質粒複製、分配相關基因,假基因,轉座酶基因等後,剩餘的57個基因全部包括在本研究內。挑選YscI與YscF相互作用進行作用機制...
蛋白質的結構決定其功能,二者之間的關係是蛋白質組研究的重點之一。對某個已知基因的特定鹼基進行定點改變、缺失或者插入,可以改變對應的胺基酸序列和蛋白質結構,對突變基因的表達產物進行研究有助於人類了解蛋白質結構和功能的關係,探討蛋白質的結構/結構域。而利用定點突變技術改造基因:比如野生型的綠色螢光蛋白(...
本申請擬以菌株SDM為研究對象,敲除D-iLDH編碼基因,確定新型D-iLDH在SDM菌株D-乳酸代謝中的關鍵作用;外源表達並分離純化該新型D-iLDH,通過圓二色譜、電子順磁共振、等溫滴定量熱及生物大分子相互作用分析等技術確定D-iLDH各結構域的生物學功能;分析該新型D-iLDH獲取及傳遞電子的具體過程,闡明該新型D-iLD...
(3) 葉綠體發育缺陷型的突變體篩選、基因克隆和功能分析。初期研究 在就讀博士期間研究了直播水稻在灌水和底溫條件下發芽和成苗的生理與分子機制,發表論文4篇,揭示了水稻澱粉酶亞族RAmy3和細胞壁伸展酶分別在種子發芽和成苗過程中重要作用。提出了氧氣, 激素GA和澱粉酶相互作用的新假設。接著從事植物細胞周期和信號...
在植物體內,ABA信號的轉導和完成與鈣信號系統中的蛋白激酶存在著網路調控的關係,尤其是CDPK-SnRK蛋白激酶家族在其中發揮著重要的作用。酵母雙雜交實驗篩選和驗證得到39個與CRK5相互作用的蛋白,其中一個具有DWD結構域的相互作用蛋白的T-DNA插入突變體種子在萌發時表現出對ABA超敏感,該蛋白命名為DWA4,即D...
第4章 基因信息的翻譯/74 4.1 遺傳密碼74 4.2 tRNA的結構和功能77 4.3 原核生物中蛋白質的合成79 4.3.1 密碼子與反密碼子的相互作用79 4.3.2 蛋白質合成的過程81 4.4 真核生物中的蛋白質合成84 4.5 翻譯的調控機制和翻譯後的加工87 中篇 基因的克隆及其功能分析 第5章 DNA的克隆/92 5.1 DNA...
隨後在該基金支持下對DDX17的協同致死作用進行驗證,並對DDX17與突變型p53相互作用的潛在分子機制進行系統研究。結果發現在突變型p53細胞上,敲低DDX17抑制細胞增殖並且誘導凋亡,而DDX17發揮協同致死作用依賴於突變型p53;DDX17與突變型p53共定位於核內,且其N端和解旋酶結構域與p53的N端發生相互作用。...
又如,胞核中脫氧核糖核酸的結構與其在遺傳中的作用息息相關;簡而言之,DNA中核苷酸排列順序的不同,表現為遺傳中的不同信息,實際是不同的基因。分子生物學。在生物化學中,有關結構與功能關係的研究,才僅僅開始;尚待大力研究的問題很多,其中重大的,有亞細胞結構中生物分子間的結合,同類細胞的相互識別、細胞...
對心肌肥厚等病理狀態研究顯示,心臟肌球蛋白基因表達及蛋白異構中存在著可塑性,推測這可能是動物機體的一種適應反應,例如超負荷刺激引起大鼠心肌肥厚可誘導左心室β-MHC基因表達及V3肌球蛋白增多,結果使心肌耗氧降低,收縮速率下降,被認為是一種經濟的適應性反應[5]。 與肌球蛋白相比,肌動蛋白結構及功能相對簡單。分...
影響蛋白質的結構與功能 基因的密碼子偏性與所編碼蛋白質結構域的連線區和二級結構單元的連線區有關、翻譯速率在連線區會降低。馬建民等通過聚類分析的方法研究發現,哺乳動物MHC基因的密碼子偏愛性與所編碼蛋白質的三級結構密切相關,並可通過影響mRNA不同區域的翻譯速度,來改變編碼蛋白質的空間構象。其研究所選取的...
金屬硫蛋白是一類富含半胱氨酸和金屬的低分子蛋白質。由於它大量的結合多種金屬離子,具有特種的生理功能,為生物化學領域所重視。MT的研究已有40多年的歷史,對其結構、特性、基因調控及生物學功能的研究日趨深入,研究成果已涉及醫學、毒理學、營養學、生物工程、美容護膚等各個領域,套用前景十分廣闊。市場狀況 根據MT...
噬菌體展示技術是將多肽或蛋白質的編碼基因或目的基因片段克隆入噬菌體外殼蛋白結構基因的適當位置,在閱讀框正確且不影響其他外殼蛋白正常功能的情況下,使外源多肽或蛋白與外殼蛋白融合表達,融合蛋白隨子代噬菌體的重新組裝而展示在噬菌體表面。被展示的多肽或蛋白可以保持相對獨立的空間結構和生物活性,以利於靶分子的...
在新版書中,增加了一些生物化學研究過程常用的技術與方法。例如,在“蛋白質”章節中,增加了蛋白質功能研究的技術與方法,包括“蛋白質的表達分析方法”“蛋白質與蛋白質相互作用研究方法”,以及“蛋白質組學及其研究技術與方法”。在“RNA的分子結構”一節中,增加了非編碼RNA,其中更詳細地介紹了環狀RNA和長鏈非...
實際上蛋白質工程包括蛋白質的分離純化,蛋白質結構和功能的分析、設計和預測,通過基因重組或其它手段改造或創造蛋白質。從廣義上來說,蛋白質工程是通過物理、化學、生物和基因重組等技術改造蛋白質或設計合成具有特定功能的新蛋白質。 利用基因工程的手段,在目標蛋白的胺基酸序列上引入突變,從而改變目標蛋白的空間結構...
④功能多樣性:雖然與DNA特異序列結合的蛋白質在每一個真核細胞中只有10 000個分子左右,約占細胞總蛋白的1/50 000,但具有多方面的重要功能,包括基因表達的調控和染色質高級結構的形成。如幫助DNA分子摺疊,以形成不同的結構域;協助啟動DNA複製,控制基因轉錄,調節基因表達等。結構模式 雖然非組蛋白種類眾多,...
遺傳性凝血因子Ⅹ缺乏是常染色體隱性遺傳性疾病編碼FⅩ的基因位於13號染色體,已被成功克隆和測序,FⅩ基因長22kb,包含8個外顯子,已經發現60餘種突變,其中絕大多數是錯義突變,主要發生於編碼催化結構域的8號外顯子。所有這些突變都不會導致截短型蛋白的產生也不會消除FⅩ的表達,這就從另一個側面說明為什麼在...
陽離子電荷殘基Lys11-Lys16構成了兩種毒素重要的結構膜序。此結構膜序被認為是軟諾丁受體激活的重要結構,因此可以認為毒素與通道蛋白是通過靜電作用,導致大量構象改變而相互作用,這為識別引起通道開放的軟諾丁受體結構域提供了有用的多肽探針。東亞鉗蠍毒素基因表達圖冊參考資料。採集分離 採集 蠍子在受到激怒的情況下...
這些特徵表明,成簇同源區是介於染色體大片段重複與完全分化之間的中間產物,因此是研究基因組進化的良好材料,被稱為基因重複的化石。染色體末端重複、單個基因重複與成簇同源區組成了酵母基因組遺傳豐余的大致結構。研究表明,遺傳冗餘中的一組基因往往具有相同或相似的生理功能,因而它們中單個或少數幾個基因的突變並不...
基因組資料庫來自基因組作圖,序列資料庫來自序列測定,結構資料庫來自X-衍射和核磁共振結構測定。這些資料庫是分子生物信息學的基本數據資源,通常稱為基本資料庫,初始資料庫,也稱一次資料庫。根據生命科學不同研究領域的實際需要,對基因組圖譜、核酸和蛋白質序列、蛋白質結構以及文獻等數據進行分析、整理、歸納、注釋...
AP1 基因和AP2 基因相互作用使萼片和花瓣特異化。AP1 基因突變使一些花變成花序,導致萼片和花瓣發育異常。金魚草AP1 同源基因SQUA突變後,開花部位發育成枝條。以上表明,AP1 基因在花器官發育上起關鍵作用。展 望 AP1 基因在植物成花過程中起關鍵作用,對其結構、功能及表達模式作進一步研究,將有助於更深入了解...