1841年，福特漢姆大學由愛爾蘭裔助理主教約翰·約瑟夫·休斯（John Joseph Hughes，1797-1864）建立，起初命名為聖約翰學院（St. John's College）。該學院是美國東北部首所天主教高等學府。1846年的聖約翰學院
1840年9月，休斯在紐約布朗克斯的福特漢姆以不足3萬美元的價格購下了幾乎全部的玫瑰山莊園（Rose Hill Manor）以修建聖約瑟夫神學院（St.Joseph Seminary），該舉措旨在效法其母校聖瑪麗山大學（Mount Saint Mary's University）。“玫瑰山”（Rose Hill）一名起源於該地所有者羅伯特·華茲（Robert Watts）於1787年的命名。羅伯特是一名紐約富商，其先祖在蘇格蘭的住宅名即為玫瑰山。1841年6月21日學校開業時，由原計畫名稱改為聖約翰學院，而彼時在校學生只有6人。日後成為紐約大主教及美國樞機主教的約翰·邁克洛斯基牧師（John McCloskey 1810-1885）成為了學校的首任校長，教職員工則均為神職人員。學校曾在5年裡先後迎來了4位教區牧師擔任校長，其中詹姆斯·羅斯福·貝利牧師（James Roosevelt Bayley，1814-1877）既是美國第32任總統富蘭克林·羅斯福（Franklin D. Roosevelt，1882-1945）的遠房侄親，又為美國首位本土出生的天主教徒伊莉莎白·安·塞頓（Elizabeth Ann Seton，1774-1821）的侄子。
1845年，神學院的教堂——懷仁聖母堂（Our Lady of Mercy）修築完成；同年，休斯主教從馬里蘭和肯塔基的聖瑪麗學院（St. Mary's Colleges）招募了一批天主教牧師以擴增教工人數。1846年，學院獲得紐約州議會的特許狀。大概在3個月之後，首批耶穌會教徒（Jesuits）抵達學院，休斯主教遂立契轉讓學院經營權但保留了大約9英畝的土地作為學院所有財產。1847年，福特漢姆大學在曼哈頓開辦了第一所學校，該校於1861年由聖弗朗西斯夏澤爾學院（St. Francis Xavier）獨立管理。同在1847年，美國作家兼詩人埃德加·愛倫坡（Edgar Ellen Poe 1809-1849）造訪福特漢姆並成為學院內耶穌會教徒的終生好友。1849年，愛倫坡發表了著名的詩歌《鐘》（The Bells ），其中部分片段被認為是由學院的鐘所激發的靈感。
聖約翰學院的課程涵蓋初階課程（例如預科課程，其中包括四年的拉丁語、希臘語、語法、文學、歷史、地理、數學和宗教的學習）及高階課程（例如學院課程，其中包括三年的人文學科、修辭學和哲學的學習）。南北戰爭聯邦軍第54麻薩諸塞志願步兵團將領羅伯特·古德爾·蕭上校（Colonel Robert Gould Shaw 1837-1863） 曾於聖約翰學院進修過初階課程。修滿初高階課程的學生可以獲得文學學士學位，此外若再進修一年的哲學課程便可獲得文學碩士學位。與現代大學的商學院類似，聖約翰學院亦提供學術證明而非學位作為傳統課程以外的選擇。 1855年，學校上演了首部學生參演的劇作-亨利五世。1859年神學院關閉時，所有的財產以4萬美元的價格於翌年被售予耶穌會。翻修前的柯林斯禮堂
由於國會通過了要求高等院校提供軍事科學及戰術指導的法案，聖約翰學院創立了一支學生團。自1885年至1890年，美國陸軍第7騎兵團的赫伯特·C·斯夸爾斯中尉（Lt. Herbert C. Squires）在學校建立了一支約200人規模的學生軍，這也是今天福特漢姆大學後備軍官訓練隊（ROTC）的雛形。聖約翰學院於1886年建立了科學大樓，使得科學課程的地位在學院的課程體系中得以提升。除此之外，學校設定了一個為期三年的科學學士學位。1897年，畢業典禮上首度出現了學位袍。
1907-1950
1905年學院新增法學院及醫學院。1907年，聖約翰學院更名為福特漢姆大學。“福特漢姆”這個名字來源於玫瑰山校區所在地-福特漢姆村。該村得名於其靠近布朗克斯河的一處淺灘，在英語中名為“Ford by the Hamlet”（村落邊的淺灘），縮略則可寫成“Fordham”（福特漢姆）。20世紀初期，福特漢姆和威斯特切斯特縣的另外幾處城鎮合併成為布朗克斯的時候，該村遂成為布朗克斯區的福特漢姆社區。 該社區存留至今，現址在玫瑰山的西邊。1905年的聖約翰學院
1913年，聖弗朗西斯夏澤爾學院（St. Francis Xavier）關閉，隨後福特漢姆大學的諸多學院選擇在曼哈頓下城的伍爾沃斯大廈（Woolworth Building）辦學，是為福特漢姆大學林肯中心的前身。後來這些學院遷至百老匯大街302號。1905年的玫瑰山校區行政大樓
1919年，因為缺乏捐助和一戰導致的財政緊張，福特漢姆大學正式關閉其醫學院。1920年，加貝利商學院（Gabelli School of Business）在曼哈頓初辦，彼時命名為會計學院。 1944年，在《退伍軍人法》（GI Bill）和老兵的支持下，專業教育和繼續教育學院（ School of Professional and Continuing Studies）建立。
1993年，林肯中心校區增設了一幢20層的學術宿舍大樓，該宿舍可容納850名學生。1996年，林肯中心校區本科部在歷經數次易名後終被命名為福特漢姆林肯中心學院（Fordham College at Lincoln Center）。自1969年成立以來，該校區先後使用過“福特漢姆大學文理學院”（The Liberal Arts College）和“林肯中心學院”（The College at Lincoln Center）的名稱。
2001至今
2002年7月，由聖心瑪麗會（Religious of the Sacred Heart of Mary ）建立於1907年的獨立女校——瑪麗蒙特學院（Marymount College）被合併入福特漢姆大學，因為該校自1970年代開始便深陷財政泥沼。合併後的學院校址仍在曼哈頓以北40公里處的塔里鎮（Tarrytown），但已改為專業教育和繼續教育學院的分部，研究生院的教育、公共服務和商業管理項目也在此處教授。,玫瑰山校區的濟廷堂（Keating Hall）
2014年以來，學校屢遭學生對校方政策的抗議。作為有天主教傳統的學校，學校致力于禁止分發及使用避孕藥物。遭禁的學生組織“性與性別平等及安全學生會”（Students for Sex & Gender Equality and Safety，SAGES）的活躍分子對此政策提出抗議。他們組織了派發保險套及各類活動以製造混亂。時至今日，呼籲學校改革的活動仍在進行之中。
學院設定
本科生院
福特漢姆大學玫瑰山校區（Fordham College at Rose Hill，1841）福特漢姆大學玫瑰山分校
專業教育與繼續教育學院（Fordham College of Professional and Continuing Studies，1944）
又稱福特漢姆大學博雅學院（Fordham College of Liberal Studies, Fordham University），就像它的名字所揭示的，該學院為非傳統學生而設立，提供全日制和半日制的學習計畫和靈活的時間表，並可以在三個校區之間進行選擇。就讀於該學院的學生仍需修滿核心課程，該學院的教員也基本上與其他學院合用。若獲邀請，在學業上卓有成就的學生可以申請參加榮譽項目（Honors Program），該項目與核心課程不同在於其高度依賴於教員監督的課題研究和獨立研究。參與該項目的學生可以在成績單和畢業證書上特加標註。
該學院為合資格的畢業生授予文學學士（B.A.）或理學學士（B.S.）學位。
研究生院
福特漢姆大學文理學院（研究生院）（Graduate School of Arts and Sciences，1916）
福特漢姆大學社會服務學院（Graduate School of Social Service，1916）
福特漢姆大學宗教與宗教教育學院（Graduate School of Religion and Religious Education1，1969）
醫科研究項目
福特漢姆大學的醫學院於1919年關閉，藥學院於1972年關閉後，學校內便不再提供與醫學直接相關的課程。但福特漢姆大學仍與葉史瓦大學的阿爾伯特·愛因斯坦醫學院（Albert Einstein College of Medicine）保持合作關係。該項目允許福特漢姆大學本科生及選修理科的研究生參加醫學課程、參與自行研究及愛因斯坦醫學院的研究項目。除此之外，該項目還包含一個物理學家導師項目，允許學生選擇一個愛因斯坦醫學院的蒙蒂菲奧里醫療中心（ Montefiore Medical Center）的物理學家參加研究。
2009年，福特漢姆大學開始與紐約醫學院（New York Medical College）就兩校合併的事宜進行談判，最終合併沒有成功，但兩校間建立了緊密的學術關係，其中包括簽署合作課程項目的條約。
學術
學術準則
福特漢姆大學的教學理念受到耶穌會的深遠影響。大學致力於發揚耶穌會“治癒人性”（Cura Personalis）的原則-教員和學校尤其尊重學生的天賦和才能，鼓勵學生挑戰自己的權威並不斷追求卓越。大學的另一個宗旨是“Homines Pro Aliis”，即激發學生服務福特漢姆大學與社會的志向。
威廉·D·沃爾什圖書館（玫瑰山校區）The William D. Walsh Library at Rose Hill
該圖書館得名於福特漢姆大學校友、校董會成員威廉·D·沃爾什（William D. Walsh）。圖書館藏有超過100萬捲圖書及38萬件政府檔案，其中不少為沃爾什所捐贈。現館內提供多媒體設備、電子工具等設備；政府檔案、檔案、特別藏書、微縮複製檔案及大學歷來論文亦可在館內的歐哈爾特別收藏室（O'Hare Special Collections Room）查閱到。玫瑰山分校另設一所科學圖書館，專門提供科技類書籍。威廉·D·沃爾什圖書館於2004年被評為全美最佳五所大學圖書館之一 。
傑拉德·M·奎恩圖書館及里奧·T·齊薩姆紀念法學圖書館（林肯中心校區） The Gerald M. Quinn Library at Lincol Center &Leo T. Kissam Memorial Law Library
該圖書館得名於已逝的林肯中心分校校長傑拉德·M·奎恩（Gerald M. Quinn）。圖書館藏有50萬捲圖書。除普通藏書之外，該館還特設商科、教育及社會服務方面的館藏以服務於林肯中心校區的3所與之相關的研究生院。
里奧·T·齊薩姆紀念法學圖書館專為福特漢姆大學法學院服務，提供法律類專業書籍。
威斯特切斯特校區圖書館（韋斯特切斯特校區） The Westchester Campus Library
馬泰奧▪瑞齊協會（The Matteo Ricci Society）是福特漢姆大學另一所負責幫助學生申請助學金的機構。通過對學術水平和其他因素的考核，學生可以受邀加入該協會，之後協會將幫助學生準備申請助學金的流程、尋找可能的實習機會並且為研究項目籌集資金。與之類似的機構還有The Rev. William E. Boyle, S.J. Society is a parallel organization for business students。
學校傳統活動
建校174年以來，福特漢姆大學逐步形成了許多今日所見之傳統活動。其中部分列出如下：
校長舞會（President's Ball）：每年秋天在同學會橄欖球賽（Homecoming football game）前夕，福特漢姆大學會舉辦一場校長舞會——該活動因由校長辦公室組織而得名。活動地址通常在文森·隆巴迪·菲爾德大樓（Vince Lombardi Field House），內容則為較為正式的商務聚會。
冬季舞會（Winter Ball）：每年一月林肯中心分校校園活動委員會（Campus Activities Board of Fordham College at Lincoln Center）會舉辦一場冬季舞會。活動地址每年在紐約市內變化，曾經的會址有彩虹屋（Rainbow Room）、俄羅斯茶屋（Russian Tea Room）和文華東方酒店（Mandarin Oriental Hotel）。
“帳篷之下”（Under the Tent）：在期末考試之前，學校會舉行名為“帳篷之下”的活動。該活動由大學宿舍聯合會（Residence Halls Association）組織，活動地址則選在學校內第二大的廣場——殉道者草地（Martyrs' Lawn）上搭築的一頂帳篷下。每年“帳篷之下”的主題均不同，通常在春季周末節（Spring Weekend Festival）期間會舉辦舞會、兩場音樂會、燒烤、環校區賽跑和喜劇表演。
九篇讀經與聖誕頌歌慶典（The Festival of Nine Lessons and Carols）：福特漢姆大學合唱團在每年的聖誕季會表演基督教傳統的九篇讀經與聖誕頌歌（Nine Lessons and Carols），活動當日下午會在玫瑰山分校的學校教堂舉辦音樂會，傍晚則會在林肯中心分校旁的使徒聖保羅教堂（Church of Saint Paul the Apostle）舉辦另一場音樂會。
該權杖由福特漢姆大學校友會（Fordham University Alumni Federation）所贈。
總統台階（The Terrace of the Presidents）：1936年至1949年出任福特漢姆大學校長的羅伯特·加努恩牧師（Rev. Robert Gannon, SJ）開啟了這項傳統。但凡有國家元首到訪過本校，他們的名字都會被鐫刻在通往濟廷堂（Keating Hall）的花崗岩石階上。這些名字中包括美國國父喬治·華盛頓，他於學校建立前便造訪過玫瑰山分校所在的玫瑰山莊園（Rose Hill Manor），以及富蘭克林·德拉諾·羅斯福、杜魯門、尼克森和其他國家的國家元首。
校歌（Alma Mater Fordham）：學校的官方校歌為《福特漢姆大學校歌》（Alma Mater Fordham），在體育賽事時則用J·伊格內修斯·柯文尼（J. Ignatius Coveney）所譜寫的《福特漢姆公羊》（Fordham Ram）。在2013年12月，《福特漢姆公羊》的歌詞中“向福特漢姆人致敬”（"Hail Men of Fordham, hail" ）改為“向福特漢姆公羊致敬（"Hail Rams of Fordham hail"），此舉旨在避免因為“men”（男人）一詞的使用而造成對占學生人數大部分的女性的歧視。
此外，學校還有一首專供遊行和運動隊獲勝之後演奏的《進行曲》（The Marching Song）。
校徽
福特漢姆大學的校徽設計之中力求體現耶穌會對學校的影響，故校徽中央放置該會的紋章。紋章上刊有耶穌基督（Jesus Christ）的希臘語字母縮寫“IHS”，字母“H”中央的上方則有一個十字架；紋章底部飾有三枚用以釘子耶穌上十字架的釘子，這些飾物均為金色。紋章則放置在一塊栗紅色鑲邊的盾牌上，盾牌周圍飾有銀色的法國鳶尾花（fleur-de-lis）用以紀念1846年來到福特漢姆大學的法國耶穌會教徒。 盾章上方為橄欖枝環繞而成的桂冠，內部則用英語書有福特漢姆大學的教學領域：“藝術、科學、哲學、醫學、法律”；盾章下方則為一條藍色的綬帶，上書大學拉丁語校訓“Sapientia et Doctrina”（智慧與學習）。該綬帶放置在一塊象徵學習的金色圓盤上，該圓盤則被象徵智慧的聖靈的巧舌（Fiery Tongues）所點綴。在整個紋章外部，環繞著書有福特漢姆大學拉丁語校名“Univerisitas Fordhamensis”的皮帶，周圍則用一圈珠狀物點綴。皮帶底部記有學校的創建時間-1841年。
2018年《美國新聞與世界報導》（U.S. News & World Report）全美最佳商學院：27；
教育學院
2015年《美國新聞與世界報導》（U.S. News & World Report）全美最佳教育學院：59
社會服務學院
2015年《美國新聞與世界報導》（U.S. News & World Report）全美最佳社會服務學院：11
其他
2015年《美國新聞與世界報導》（U.S. News & World Report）全美最佳英語語言項目：63
獨立系統
福特漢姆大學加入了全國獨立學院及大學聯盟（National Association of Independent Colleges and Universities）的大學及學院責任系統（University and College Accountability Network,U-CAN）用以提供比傳統排名更為全面而廣泛的數據供學生在擇校時參考。
知名校友
知名教授
Kevin Mirabile - Hedge Fund Investing 一書作者，他為福特漢姆大學開創了全美唯一的另類投資專業，讓學生可以學習私募基金，地產金融，對沖基金的致使，參與並完結此項目的頂點課程賦予學生CAIA（另類投資分析師）證書。Kevin曾認全美知名對沖基金顧問，並正在撰寫超另類投資一書。
Victor Francis Hess- 奧地利美國物理學家，諾貝爾物理學獎獲得者，他發現了宇宙射線[1]。
泰勒·席林（Taylor Schilling）美國Netflix熱播電視劇《女子監獄》（Orange Is the New Black）的女主角Piper Chapman的扮演者，並以此角色獲得2013年衛星獎電視系列音樂、喜劇片最佳女主角，以及2014年金球獎戲劇電視系列最佳女主角和黃金時段艾美獎喜劇系列最佳女主角的提名。
Alan Alda - 美國演員，導演，編劇和作者。曾七次獲得艾美獎和金球獎得主
Don DeLillo - 國家圖書獎和筆/福克納獎獲獎作者
Mike Breen- 美國廣播公司的NBA美國體育評論員，也是MSG網路上紐約尼克斯隊比賽的首席播音員。
Vin Scully- 艾美獎獲獎播報員 洛杉磯道奇隊運動員;棒球名人堂;無線電名人堂
Loretta Tofani-普利茲獎得主記者
Alice Smith- 葛萊美獎提名歌手
Tom Courtney - 在1956年夏季奧運會上獲得兩枚金牌，在880碼比賽創造了世界紀錄
Robert Sean Leonard- 金球獎獲獎電視節目演員
Chrissy Costanza (克麗希·克斯丹薩, 1995- ) - 畢業於福坦莫,美國著名網路歌手,在2011年加入 Against The Current(ATC)。2012年在YouTube大受好評。
Charles Osgood - 三次艾美獎和兩次Peabody獲獎記者
Mary Higgins Clark- 國際和紐約時報暢銷作家超過50個懸念小說，40多年的懸疑小說女王
全美天主教大學入學獎學金（The National Catholic College Admission Association Scholarship）：福特漢姆大學作為全美天主教大學聯盟（The National Catholic College Admission Association）的一員，可為符合資質的學生提供8次、每次$1000的獎學金。 2016年申請的截止日期為2月初，獲獎通知在當年4月中旬傳送。
1846年的聖約翰學院
翻修前的柯林斯禮堂
1905年的聖約翰學院
1905年的玫瑰山校區行政大樓
1913年的伍爾沃斯大廈校區
艾森豪總統宣布林肯中心揭幕
玫瑰山校區禮拜堂
玫瑰山校區的濟廷堂（Keating Hall）
福特漢姆大學玫瑰山分校
福特漢姆大學林肯中心分校
福特漢姆大學法學院
杜安圖書館
玫瑰山校區的阿爾法屋
福特漢姆大學吉祥物——公羊
福特漢姆大學校徽