《目標區域測序數據的雲存儲與雲套用機制研究》是王立坤為項目負責人，北京大學為依託單位的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：目標區域測序數據的雲存儲與雲套用機制研究
- 項目類別 ：青年科學基金項目
- 依託單位 ：北京大學
- 項目負責人：王立坤
科研成果 ,項目摘要,
科研成果
序號 | 標題 | 類型 | 作者 |
|---|---|---|---|
1 | cisPath: an R/Bioconductor package for cloud users for visualization and management of functional protein interaction networks | 期刊論文 | Wang, Likun(#)，Yang, Luhe，Peng, Zuohan，Lu, Dan，Jin, Yan，McNutt, Michael，Yin, Yuxin(*) |
2 | Systematic analysis of gene expression patterns associated with postmortem interval in human tissues | 期刊論文 | Zhu, Yizhang(#)，Wang, Likun，Yin, Yuxin(*)，Yang, Ence(*) |
3 | SoftPanel: a website for grouping diseases and related disorders for generation of customized panels | 期刊論文 | Wang, Likun(#)，Zhang, Cong(#)，Watkins, Johnathan，Jin, Yan，McNutt, Michael，Yin, Yuxin(*) |
4 | UltraPse: A Universal and Extensible Software Platform for Representing Biological Sequences | 期刊論文 | Du, Pu-Feng(#)，Zhao, Wei，Miao, Yang-Yang，Wei, Le-Yi，Wang, Likun(*) |
項目摘要
隨著測序技術的發展，高通量的基因組測序成本將會進一步顯著下降。目標區域測序僅特異的捕獲並測序基因組上某些區域的信息，因此成本更低。可以預見，越來越多的個人會選擇目標區域測序甚至全基因組測序，並以此來指導自己的日常生活方式和個性化醫療方案。但是，普通用戶並不具備整合和分析各種測序數據的能力，需要藉助特定的軟體和套用來進行相應的分析。本研究從實際套用的角度出發，研究目標區域測序數據的雲存儲與雲套用機制。研究過程中我們將首先從公開發布的高通量測序數據中篩選出目標區域測序數據特別是全外顯子組數據，並進行標準化處理。在測序數據的基礎上，進行各種雲存儲機制的實驗和雲套用的開發。後期根據軟體與雲套用的測試結果對存儲方式和相應套用進行進一步的改進並公開發布。這項研究旨在促進雲計算服務與個性化醫療的大眾普及，使得普通大眾可以進一步分享科學研究帶來的生活及醫療水平的提升。
