主要職責,內設機構,
主要職責
擬定機構編制、幹部管理、勞動工資、專業技術資格與職務評聘等方面的部門規章、制度，並組織實施。負責部機關、派出機構和直屬單位的機構編制、勞動工資、專業技術資格與職務評聘、駐外人員和出國留學、培訓、訪問學者選派等管理工作。組織全國環境保護行政表彰。承擔環境保護行政管理體制改革工作。指導環境保護系統機構改革與人事管理工作。協助部黨組對環境保護系統領導幹部實行雙重管理。協助開展地方黨政領導班子環境保護政績考核工作。歸口管理環境保護系統人才隊伍建設、幹部培訓、職（執）業資格工作和證書審核發放。
內設機構
1、綜合處
承擔司內文電、會務、機要、保密、安全、印章、檔案、財務預算、固定資產管理、政務信息與公開、工作計畫與總結等綜合性事務和綜合協調工作；承擔部機關幹部兼職管理；辦理部機關和有關派出機構、直屬單位人員出國政治審查。
2、行政體制改革處（簡稱體改處）
組織開展環境保護行政管理體制改革；擬訂機構編制管理規章、制度，並組織實施；承擔部機關、派出機構、直屬單位機構編制管理工作；指導環境保護系統機構改革工作。
3、幹部一處
擬訂部機關（含環境應急與事故調查中心、機關服務中心）幹部管理規章、制度，並組織實施；承擔部機關公務員和幹部管理工作；承擔軍轉幹部接收安置和幹部掛職鍛鍊、京外調（遷）入人員審核備案、駐外人員選配等工作；承擔幹部檔案管理。
4、幹部二處
擬訂派出機構、直屬單位幹部管理規章、制度，並組織實施；承擔派出機構、直屬單位領導幹部管理工作和中層幹部備案審批；承擔省級環境保護行政主管部門領導班子雙重管理工作；協助開展環境保護政績考核工作；指導派出機構、直屬單位幹部人事制度改革。
5、人力資源處（培訓管理處）（簡稱人才處）
擬訂部機關、派出機構、直屬單位的勞動工資、專業技術資格與職務評聘、社會保險等規章、制度，並監督執行；擬訂環境保護人才戰略和幹部培訓規劃；承擔部機關幹部勞動工資管理工作；承擔專業技術職（執）業資格管理和證書審核發放；組織行政表彰工作；組織京內直屬單位應屆畢業生接收計畫審核和指標報批；承擔引智和留學人員、訪問學者管理工作；審核機關各部門業務培訓計畫；承辦中組部黨政領導幹部培訓工作，組織開展地市級局長崗位培訓工作；歸口管理出國培訓；承擔環境保護系統人員出國進修培訓選派工作；指導直屬單位培訓工作。
6、幹部監督處
擬訂部幹部監督規章、制度並組織實施；承擔幹部監督工作；承擔部領導批示的民眾來信舉報核查工作；對派出機構、直屬單位組織人事工作進行監督；參加部巡視相關工作。
