α-螺旋

α-螺旋

α-螺旋(α-helix)蛋白質二級結構的主要形式之一。指多肽鏈主鏈圍繞中心軸呈有規律的螺旋式上升,每3.6 個胺基酸殘基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距為0.54nm,兩個胺基酸殘基之間的距離為0.15nm。螺旋的方向為右手螺旋。胺基酸側鏈R基團伸向螺旋外側,每個肽鍵的肽鍵羰基氧和第四個N-H形成氫鍵,氫鍵的方向與螺旋長軸基本平行。由於肽鏈中的全部肽鍵都可形成氫鍵,故α-螺旋十分穩定。

基本介紹

  • 中文名:α-螺旋
  • 類型:蛋白質的二級結構
  • 螺距:0.54nm
  • 螺旋的半徑:0.23nm
主要特徵,形成因素,偶極距,帽化,

主要特徵

肽鏈以螺旋狀盤卷前進,每圈螺旋由3.6個胺基酸構成,螺圈間距(螺距)為5.44埃;②螺旋結構被規則排布的氫鍵所穩定,氫鍵排布的方式是:每個胺基酸殘基的N—H與其氨基側相間三個胺基酸殘基的C=O形成氫鍵。這樣構成的由一個氫鍵閉合的環,包含13個原子。因此,α-螺旋常被準確地表示為3.6/13螺旋。螺旋的盤繞方式一般有右手旋轉和左手旋轉,在蛋白質分子中實際存在的是右手螺旋。
α-螺旋

形成因素

①側鏈基團的電荷性質和大小都有影響,甘氨酸由於側鏈太小,構象不穩定,是α螺旋的破壞者;② 連續存在帶相同電荷的胺基酸殘基;③ 不存在脯氨酸殘基,脯氨酸由於其亞氨基少一個氫原子,無法形成氫鍵,而且Cα-N鍵不能旋轉,所以是α螺旋的破壞者,肽鏈中出現脯氨酸就中斷α螺旋,形成一個“結節”。

偶極距

α-螺旋中所有氫鍵都沿螺旋軸指向同一方向。每一肽鍵都有由N-H和C=O的極性產生的偶極距。

帽化

所謂帽化就是給末端裸露的N-H和C=O提供僅見氫鍵配偶體(partner),並摺疊蛋白質的其他部分以促成與末端的非極性殘基的疏水作用

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