α螺旋體

α螺旋體是蛋白質二級結構的主要形式之一。指多肽鏈主鏈圍繞中心軸呈有規律的螺旋式上升,每3.6 個胺基酸殘基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距為0.54nm,兩個胺基酸殘基之間的距離為0.15nm。螺旋的方向為右手螺旋。胺基酸側鏈R基團伸向螺旋外側,每個肽鍵的N-H和第四個肽鍵的羰基氧形成氫鍵,氫鍵的方向與螺旋長軸基本平行。

二級結構以往是由生物巨分子在原子量級結構下的氫鍵來定義的。在蛋白質,二級結構則是以主鏈中氨基之間的氫鍵模式來定義,亦即DSSP所定義的氫鍵,並不包括主鏈與旁鏈間或是旁鏈之間的氫鍵。而核酸的二級結構是以鹼基之間的氫鍵來定義。在很多RNA分子,二級結構對RNA正常功能非常重要,有時甚至於較序列重要。

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