農業資金來源審計是對農業企業資金的完整性、合理性和合規性的審核、稽查。其主要內容:(1) 由國家撥給的資金是否保持完整。(2) 以何種方式自籌資金,自籌資金在全部資金中所占比重是否逐年有所增加。(3) 能否適應大力開展多種經營、積極發展商品經濟、促進農業生產現代化的客觀形勢。(4) 在吸收外部投入的資金,實行股份集資時,所採取的形式是否合法、合理,有無損害國家利益的不法行為。(5) 採取何種方式吸收外資,是否按規定程式辦理手續。(6) 是否按規定程式取得基本建設貸款; (7) 銀行流動資金貸款是否按規定辦理和按用途使用,並獲得應有的經濟效益。