農業科技三項費用審計是對農業新產品試製、中間試驗、科學研究三項補助費的審計。其主要內容：(1)審查新產品試製計畫、預算是否正確合理，審批手續是否完備合規；(2)審查費用支出的合規性，是否有挪用或轉移資金的行為；(3)審查帳務處理及有關憑證的真實性和正確性；(4)審查項目的進度是否按計畫執行，項目質量是否達到標準要求。
支援經濟不發達地區發展資金審計 對國家支援經濟不發達的革命老根據地，少數民族地區、邊遠貧困地區發展經濟的專項資金的審計。其主要內容：(1)資金使用是否做到專款專用；(2)審查資金支出使用的合規性，是否有揮霍浪費現象；(3)資金使用有無截留和挪用行為，重點審查有無將此資金用於行政事業單位人員經費開支、提高各種開支標準和福利費的補助，企業虧損的彌補和大中型基本建設投資。
