《糖蛋白及其天線結構的生物質譜分析》是依託復旦大學，由楊芃原擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：糖蛋白及其天線結構的生物質譜分析
- 依託單位：復旦大學
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：楊芃原
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
作為一種普遍存在的翻譯後修飾，糖基化對蛋白質的結構和功能有著重要影響。蛋白質糖基化的複雜性決定了糖基化相關分析是對分析技術的一大挑戰。尤其是對糖鏈結構的分析尚缺乏有效的分析工具。本課題試圖建立研究蛋白質糖基化修飾譜的共性質譜分析技術：發展凝集素親和色譜/肼化學法等富集糖肽的技術和外切糖苷酶分離糖鏈的技術，結合使用高精度的Orbitrap和FTICR質譜儀以解決糖蛋白的糖基化位點分析問題；發展Nano-ESI/MALDI為離子源的多級串級質譜分析技術，以解決糖鏈分支結構的分析問題；發展ETD和CID結合的高解析度、高靈敏的質譜技術，以解決支鏈的糖基序列分析問題；發展基於專家知識的糖蛋白子庫產生/搜尋和質譜儀器參數的反饋控制，以解決糖蛋白鑑定的結構半自動分析問題。本課題還將利用建立的質譜分析技術，對前期研究發現的肝癌相關的糖蛋白進行糖鏈分析。
結題摘要
發展了凝集素親和色譜/肼化學法等富集糖肽的技術和外切糖苷酶分離糖鏈的技術，結合使用高精度的Orbitrap質譜儀解決了糖蛋白的糖基化位點分析問題；發展Nano-ESI/MALDI為離子源的多級串級質譜分析技術，部分解決了糖鏈分支結構的分析問題；發展了基於專家知識的糖蛋白子庫產生/搜尋和質譜儀器參數的反饋控制，編寫了GRIP糖蛋白之結構解析軟體，部分解決了糖蛋白鑑定的結構半自動分析問題。對前期研究發現的肝癌相關的糖蛋白進行了糖鏈鑑定。 在課題執行期間，項目主要參加者，博士生陳瑤函、汪弘、張偉畢業並獲得博士學位。和本課題有關的研究內容，分別在以下會議上報告和牆報：日內瓦國際蛋白質組組織年度大會，韓國亞洲糖生物學和化學資料庫研討會，長春糖生物學會議，長春質譜學會年會，北京BECIA會議，杭州中國蛋白質組組織大會、亞澳蛋白質組組織大會等。 共發表SCI論文 11篇。
