《基於生物質譜技術高通量鑑定蛋白糖基化修飾的新方法》是依託復旦大學，由張揚擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：基於生物質譜技術高通量鑑定蛋白糖基化修飾的新方法
- 依託單位：復旦大學
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：張揚
- 批准號：31300680
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
蛋白質糖基化修飾的重要性不言而喻，但一直缺乏一種高通量技術可在組學水平上觀測生物體內糖鏈結構的變化，如果這一領域得到攻克，可以很大程度的幫助生物學家重新認識糖及其結構在生物體中的作用。我們利用糖組學中常用的實驗方法並結合質譜儀的各類特性，初步建立了一套N-糖肽組成的高通量鑑定方法（GRIP），能夠輔助實驗人員快速準確地從海量譜圖中識別糖肽，給出肽段序列、修飾位點，糖鏈組成等支持證據。標準糖蛋白以及人類血清樣品的預實驗表明GRIP有一定的準確度，但仍需不斷完善。通過本項目，一方面我們將最佳化、拓展GRIP軟體功能，使其能夠利用不同類型的質譜來鑑定多物種、多組織器官中表達的N-糖蛋白與O-糖蛋白，另一方面將GRIP方法運用到實際複雜樣品中，鑑定小鼠肝臟組織中糖蛋白及糖鏈結構的種類，深入挖掘肝癌轉移過程中參與的糖蛋白及其糖型結構的變化，並設計實驗驗證。
結題摘要
蛋白質糖基化修飾的重要性不言而喻，但一直缺乏一種高通量技術可在組學水平上觀測生物體內糖鏈結構的變化，如果這一領域得到攻克，可以很大程度的幫助生物學家重新認識糖及其結構在生物體中的作用。我們基於現有的質譜技術，開發了一些糖蛋白質組搜尋引擎和實驗體系。在研究的4個階段中，分別建立了GRIP、pGlyco和pGlyco+這三個軟體方法和實驗體系，外加一個糖鏈拓撲結構庫pGlycoDB。而pGlyco+最有希望成為國內最主流的糖蛋白鑑定方法。同時，我們在人類血清樣品、小鼠的各個臟器中都得到了完美的測試結果。
