模式生物分子網路的比較生物學研究

《模式生物分子網路的比較生物學研究》是依託中國科學技術大學,由梁治擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:模式生物分子網路的比較生物學研究
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:梁治
  • 依託單位:中國科學技術大學
中文摘要,結題摘要,

中文摘要

近年來,隨著系統生物學的興起和生物技術的進步,各種模式生物的分子相互作用數據快速積累,這為我們從分子網路水平系統性的研究生命現象打開了視窗,不過也對如何分析和理解由此產生的海量數據提出了巨大的挑戰。作為生命科學研究的重要手段,比較生物學自達爾文時代起就發揮了巨大的作用。正如基因組計畫極大的依賴於並推動了序列比較方法的發展,分子網路的研究必然也將依賴並推動分子網路水平的比較生物學研究。本課題擬在原有工作基礎之上,繼續開展模式生物分子網路的比較生物學研究,針對多重網路比較、以基因調控網路為代表的有向網路比較和基於分子網路進化模型的網路比較評判等該領域的關鍵問題展開研究,並通過項目的開展,發展和建立一套較為完善的、高效的、獨具特色的分子網路比較方法和工具。本課題的開展將有望為未來的分子網路比較和分析研究奠定基礎,具有重要的理論意義和套用價值。

結題摘要

隨著大規模高通量生物技術的發展和套用,生命科學研究正逐漸從單個分子轉向分子間的相互作用以及由它們所形成的複雜網路系統。分子間相互作用數據的積累,為我們研究生命現象和疾病打開了新的視窗,同時也對我們如何處理和分析這些海量數據提出了新的問題。作為生命科學研究的重要手段,比較生物學的分析方法自達爾文時代起就發揮著不可估量的作用。基於網路比較生物學研究方法為我們理解和認識生物系統的組織方式提供了一種新的途徑。本課題直接靶向分子網路比較領域的關鍵問題,主要針對多重蛋白質相互作用網路比較和蛋白質網路的進化模型等問題展開研究。在課題的資助下,我們建立了一套支持多重蛋白質相互作用網路比較的方法及相應的軟體工具mNetAlign;通過比較生物學的方法研究了蛋白質相互作用網路水平的共進化,建立了蛋白質相互作用網路水平的共進化模型;同時,初步建立起支持雙重有向網路比較的方法。這些成果推進了基於網路的比較生物學研究。除此之外,在課題的資助下,我們對microRNA的調控活性也開展了一些研究,並獲得了良好的進展。

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