《基因調控網路重建的最最佳化模型與算法研究》是依託中國科學院數學與系統科學研究院，由王勇擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：基因調控網路重建的最最佳化模型與算法研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：王勇
- 依託單位：中國科學院數學與系統科學研究院
- 批准號：10801131
- 申請代碼：A0405
- 負責人職稱：研究員
- 研究期限：2009-01-01 至 2011-12-31
- 支持經費：17（萬元）
項目摘要
細胞通過基因調控實現複雜的生命功能。利用微陣列基因表達數據構建基因調控網路是當前生物信息學和系統生物學的一個前沿研究熱點。主要的挑戰在於建立涉及成千上萬變數的調控網路模型和克服生物實驗產生的高噪聲、相對缺乏的數據造成的病態多解現象。本研究計畫中，我們將利用最最佳化方法來集成從不同尺度、角度、層面提供調控信息的異源生物數據，推斷轉錄因子、基因、環境因素、化學小分子以及非編碼RNA之間的調控作用，並識別那些在不同條件下產生回響的信號通路。在方法論研究中，我們將根據實際問題和數據結構的特點在最最佳化建模中強調凸性和正則化項，以保證複雜生物問題的簡化以及求解算法的高效。本項目的研究不僅可以為生物學家提供可靠的方法論和實用高效的工具軟體，而且可以推動最最佳化理論和算法與生物分子網路和數據集成的交叉研究，加快國內系統生物學這一新興交叉學科的發展。
