存款業務審計是“貸款業務審計”的對稱。存款是指存入銀行的貨幣資金。一般包括結算戶存款、專項存款和專用基金存款等，存款業務審計有助於企業節約資金，保護財產安全，保證各項業務活動正常進行。根據有關政策和法規，對銀行各類存款的組織管理和吸收存款工作的審計。銀行存款按其來源可分為經濟組織存款、儲蓄存款、財政存款等項。根據各類存款的特點，審計的重點是：（1）從巨觀上對存款管理的原則和確定吸收存款、運用存款的比例進行審計、分析。審計銀行在計算一個時期的通貨量時，是否充分考慮了存款通貨因素；是否採取了鼓勵存款、方便存款的措施，促進存款由短期性向穩定性轉化；在發放貸款時是否充分考慮了存款的來源和性質所起的制約作用；是否根據存款的適當穩固率和國民經濟發展的需要，科學地規定了存款運用率；是否利用利率槓桿作用管理存款、調節資金。（2）審查銀行在帳戶管理和使用上是否積極擴大存款業務範圍，爭取多開戶；是否按規定使用銀行帳戶，有無借用、出租轉讓等問題。在儲蓄存款方面，審計銀行是否按儲蓄原則、儲蓄政策辦理儲蓄；儲蓄機構管理方面是否貫徹落實有關規章制度，憑證管理是否符合要求。（3）審計銀行存款結餘額的正確性，即審查銀行存款日記帳的結存餘額。（4）審查銀行存款收支的真實性、合理性和合法性，即有無利用銀行存款存入和支出搞貪污舞弊，有無套取現金搞非法活動，有無利用外借企業帳戶，從中漁利。（5）審查銀行存款的效益性等。
