基於非編碼RNA調控網路的複雜疾病致病模式發現研究

《基於非編碼RNA調控網路的複雜疾病致病模式發現研究》是依託西安電子科技大學,由高琳擔任項目負責人的重大研究計畫。

基本介紹

  • 中文名:基於非編碼RNA調控網路的複雜疾病致病模式發現研究
  • 項目類別:重大研究計畫
  • 項目負責人:高琳
  • 依託單位:西安電子科技大學
中文摘要,結題摘要,

中文摘要

複雜疾病是生命科學及相關學科的核心研究內容之一,與非編碼RNA(ncRNA)密切相關:其發生和惡化是ncRNA之間複雜調控的結果。從ncRNA之間高度複雜的調控關係中挖掘導致疾病的ncRNA調控關係,極具挑戰性。本項目在2015年1月提交結題報告的國家自然科學重大研究計畫培育項目成果基礎上,針對新一代測序ncRNA數據和表達數據,研究致病ncRNA調控模式、並對相關ncRNA及其調控模式發現理論與方法研究。為規避建立ncRNA網路基礎上致病ncRNA子網搜尋所導致的計算和存儲複雜性問題,鑒於疾病相關ncRNA功能模組具有內部封閉性的特點,提出步步為營的致病ncRNA調控網路動態構建技術,即從某個起點出發、通過不斷搜尋的動態過程,實現網路構建,並對網路的圖譜特性、可控制性等拓撲特性深度分析,提出致病模式發現方案,為全面、系統了解複雜疾病的發生、發展機理和對複雜疾病實施有效控制提供有力依據。

結題摘要

本項目緊緊圍繞非編碼RNA與複雜疾病致病模式,分幾個層次展開研究:全基因組SNP,SCNA層次;miRNA層次;miRNA-mRNA相關關係層次等;此外還研究了piRNA/lncRNA預測。研究內容包括複雜疾病致病miRNA的調控網路模組研究、泛癌miRNA協作關係研究、piRNA的識別、lncRNA預測研究、miRNA-mRNA互動作用及與複雜疾病關係的研究、體細胞拷貝數變異與複雜疾病的關聯性研究、複雜疾病的致病位點研究等。涉及的複雜疾病包括老年性黃斑退化症(AMD)、各種神經系統疾病(神經分裂症,孤獨症,多動症)以及12種典型癌症(包括膀胱癌、乳腺癌、肺癌、結腸癌、腎癌、白血病、子宮內膜癌、直腸癌等)。

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