三維基因組手段是破解遺傳機理的“關鍵鑰匙”,通過三維基因組的手段來解析玉米中順式調控元件的作用機制顯得尤為重要。
基本介紹
- 中文名:三維基因組
- 別名:三維基因組圖譜
三維基因組手段是破解遺傳機理的“關鍵鑰匙”,通過三維基因組的手段來解析玉米中順式調控元件的作用機制顯得尤為重要。
三維基因組手段是破解遺傳機理的“關鍵鑰匙”,通過三維基因組的手段來解析玉米中順式調控元件的作用機制顯得尤為重要。2019年6月,華中農業大學科研團隊成功繪製玉米活躍表達基因參與的高解析度三維基因組圖譜,鑑定了基因組順式調...
甲醛將基因鏈上相互分離而在三維空間相互鄰近的基因緊密粘合在一起。然後科學家添加一種化學藥劑將緊緊排列在一起的基因鏈分解,但完整保留了甲醛連結。結果顯示許多基因都是成對排列,仿佛一個凍住的麵條球,被分切成一百多萬層碎片並混合在一起。通過對基因對的研究,科學家分辨出在最初的基因組中那些基因是互相...
武漢菲沙基因信息有限公司位於武漢國家生物產業基地——光谷生物城,是一家集三維基因組學技術服務、第二代和第三代基因測序、生物信息軟體開發、生物信息分析、基因組資料庫搭建、基因檢測技術研發等生物信息上下游產業於一體的高新技術企業。菲沙基因聯合國內外著名高校和科研機構,擁有一批國際知名的基因組學和生物信息學...
張玉波長期專注於動物三維基因組學研究,探索非編碼DNA調控元件對動物基因轉錄調控的影響,並構建模式動物三維基因轉錄的精確調控網路。他帶領團隊對ChIA-PET技術進行改良,並以此為基礎發現了4萬個基因在轉錄過程中的遠程互作,繪製了不同細胞內三維網路轉錄調控圖,Faculty of 1000等知名評論媒體認為這一創新對細胞及...
《真核生物mRNA與三維遺傳信息研究》是依託雲南大學,由劉次全擔任負責人的國家自然科學基金資助重大研究計畫。項目簡介 建立了由一維符號序列表征RNA二級結構的四行圖表示, 該程式可用字元串形式表示出已知核苷酸序列的任何RNA的預測二級結構及對應蛋白質的二級結構單元和活性位點。進一步在對SARS冠狀病毒的RNA=級結構序列...
《植物基因組學》是2020年科學出版社出版的圖書,作者是樊龍江。內容簡介 本教材分為總論和各論兩篇,分別包括15章和10章。總論系統介紹了植物基因組學的基礎理論和方法,包括植物基因組測序拼接、轉錄修飾、進化選擇、育種利用,以及植物單細胞基因組、三維基因組和合成基因組等前沿研究,同時兼顧植物群體基因組和細胞...
《致齲變形鏈球菌全基因組的蛋白表達及三維結構研究》是蘇曉東為項目負責人,北京大學為依託單位的青年科學基金項目。科研成果 項目摘要 齲齒病是累及全人類的細菌感染性疾病,WHO已將其列入危害人類健康的三大疾病僅次於心腦血管病和癌症,我國衛生部和國家教委已把齲齒列為2000年學生重點防治疾病之一。大量研究證明變形...
人類基因組,又稱人類基因體,是指人的基因組,由23對染色體組成,其中包括22對常染色體,1對性染色體。人類基因組含有約31.6億個DNA鹼基對,鹼基對是以氫鍵相結合的兩個含氮鹼基,以胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)和鳥嘌呤(G)四種鹼基排列成鹼基序列,其中A與T之間由兩個氫鍵連線,G與C之間由三個氫鍵連線,鹼...
1.解析三維基因組結構形成與調控的分子機制 2.探索衰老、生殖與發育等過程中的基因調控機制 3.開發研究三維基因組結構與動態的新方法 研究方向 三維基因組結構、表觀遺傳學、發育與衰老的調控機制 研究成果 Wang B*, Ji L*, Bian Q#, “SATB1 regulates 3D genome architecture in T cells by constraining ...
李程,男,博士,北京大學生命科學學院研究員。2020年8月11日,李程入選“2020年度國家傑出青年科學基金建議資助項目申請人名單”。個人介紹 基於對癌症基因組中非整倍體變異頻繁出現的原因和後果的研究興趣和基礎,李程研究組在2014年開始將研究重心聚焦在癌症三維基因組學領域,通過自主建立的Hi-C實驗和分析流程,首先...
參與了油菜玉米等作物的三維基因組互作和表觀基因組圖譜等研究。近2年來以第一作者和共一作者身份在Nat Commun、Mol Plant國際雜誌(IF>10)發表SCI論文2篇。科研項目 2021-2027廣西大學-助理教授科研啟動經費(主持;費用:40萬)2021-2023廣西大學-農學院人才資助項目(主持;費用:10萬)國家自然科學基金委員會,...
腫瘤學 博士 2001年 – 2004年 暨南大學醫學院 生物化學與分子生物學 碩士 1995年 – 2001年 華中科技大學同濟醫學院 臨床醫療 學士 研究領域 1. 單細胞、單分子染色質互動作用技術研發及套用 2. 全基因組RNA-染色質DNA互動作用技術研發及套用 3. RNA介導的三維基因組空間結構及其轉錄調控機制 ...
2016年開始在路德維格癌症研究所(加州大學聖地亞哥分部)從事博士後研究(導師任兵),參與編制哺乳動物胚胎髮育的表觀遺傳圖譜(ENCODE)和三維基因組變化。曾獲美國NIH Pathway-to-Independence K99/R00基金資助;現加入西湖大學生命科學學院任特聘研究員。研究方向 每個人,甚至已知的每個生命體,都將經歷不可逆的衰老...
光學成像和生物化學等多學科技術開展三維基因調控凝聚體的分子機理、動態變化和疾病的相關研究。主要致力於:1,三維染色質凝聚體和調控因子的系統鑑定。2,單細胞和全基因組水平上三維染色質凝聚體裝配與動態調控。3,研究幹細胞命運決定,細胞周期以及疾病發生過程中的三維染色質凝聚體的分子機制和結構基礎 。
2012-2016瑞典于默奧大學,群體基因組學,博士 2016-2019挪威生命科學大學,進化遺傳學,博士後 2019-2020 四川大學生命科學學院,特聘研究員 2020-至今 四川大學生命科學學院,教授 研究方向 本實驗室主要利用生物信息學分析方法對多組學數據(基因組、轉錄組、三維基因組、甲基化組、代謝組等)進行整合研究,通過與分子...
2、三維基因組的機理、功能和套用。整合染色質互作、表觀組和轉錄組等多組學數據解析三維基因組形成機理和調控功能;結合實驗和計算研究三維基因組在重要生物過程中的動態變化及其生物功能;三維基因組輔助基因組組裝和遺傳變異檢測等。發表論文 (#表示共同第一作者,*通訊或並列通訊作者)1. Zi Wen, Zhi-Tao Huang...
而那么我們的2米長的基因組DNA分子又是怎樣組裝、緊密壓縮到10-20微米的細胞核空間內的呢?細胞中有一類性質特異的蛋白質,組蛋白八聚體,能夠組裝基因組DNA形成染色質,並進一步摺疊凝聚形成非常複雜的染色質三維結構,把基因組DNA壓縮到真核生物的細胞核內。2. 染色質的三維結構 在真核細胞中,DNA總是以染色質...
對遺傳毒性激活的SIRT1基因的表達調控及其與心肌梗死關係的研究為預防和治療心肌梗死提供了方案。研究方向 1、研究由lncRNA和三維基因組結構所組成的三維轉錄調控在腦衰老中的作用 2、研究lncRNA和染色質相互作用在精子發生過程中的轉錄調控作用 3、研究減數分裂相關特定基因的功能及其分子機制 論文專著 (1) Three-...
本實驗室將致力於:(1)動物胚胎早期發育過程中的表觀遺傳調控;(2)幹細胞分化過程中的表觀遺傳調控;(3)調控序列如啟動子、增強子、絕緣子以及三維基因組在發育和細胞命運決定過程中的功能;(4)表觀遺傳相關人類疾病的調控機理。代表性論文 1. Shuyan Ji,* Fengling Chen,* Paula Stein,* Jiacheng Wang...
主持中國科學院戰略性先導科技專項(A類)子課題“特色觀賞和藥用植物的基因標識研究與關鍵物種的產地溯源”(XDA23080203,2019-01至2023-12,200萬元);主持國家自然科學基金委員會面上項目“多倍化後小麥基因組和三維基因組結構變異及其進化意義的研究”(31870209,2019-01至2022-12,60萬元);代表性論文 Jiao ...
2. 植物功能基因組、植物三維基因組;3. 穀子功能成分、食味品質分子機制和套用研究;4. 穀子耐鹽鹼分子機制和套用研究。主講課程 為研究生講授《研究生常用軟體》、《生物學及研究進展》課程;為本科生講授《Perl語言編程》、《數據挖掘》、《生物信息學前沿》、《資料庫套用》課程。學術成果 為共一作者...
11.2 核小體定位與基因調控 229 11.3 組蛋白分子伴侶 233 11.4 染色質重塑複合體 238 11.5 染色質重塑與疾病 243 參考文獻 244 第12章 染色質結構與組蛋白變體 247 12.1 染色體結構 247 12.2 組蛋白變體 254 參考文獻 261 第13章 CTCF與三維基因組染色質高級結構 265 13.1 ...
雖然前期我們對擬南芥多倍體A.suecica的研究取得了一些突破性的進展,但是其A亞基因組的供體A.arenosa一直沒有測序,給多倍體研究造成了很大的障礙。我們採取分子進化、基因組學、表觀遺傳和系統生物學的方法,利用全基因組二代,PacBio三代,Hi-C染色質三維基因組和RNAseq測序等先進技術,完成了自然和新合成A....
湖北省高等學校優秀中青年科技創新團隊:三維基因組學團隊 科研成果 2019年,學院獲批國家自然科學基金項目10項,人獲批湖北省自然科學基金項目6項。全年教師共發表SCI收錄論文55篇。2020年,學院獲批國家自然科學基金項目10項,其中面上項目6項,青年項目3項,優青項目1項,人才類項目取得突破,直接經費563萬元。獲批...