李旭凱(山西農業大學副教授)

李旭凱(山西農業大學副教授)

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李旭凱，博士，副教授，碩士生導師，生物信息系主任。

基本介紹

  • 中文名：李旭凱
  • 國籍：中國
  • 民族：漢
  • 出生地：山西太原
  • 出生日期：1986年7月
  • 畢業院校：華中農業大學
  • 學位/學歷：博士
  • 職業：教師
  • 專業方向：生物信息學
  • 職務：生物信息系主任
  • 學術代表作：Molecular plant
    Nature Plants
  • 就職院校：山西農業大學生命科學學院
  • 職稱：副教授
  • 籍貫：山西太原
教育經歷,工作經歷,研究領域,主講課程,學術成果,主持科研項目,參與科研項目,獲獎榮譽,

教育經歷

2010.07 - 2017.06，華中農業大學，作物遺傳育種，碩博連讀 / 博士；
2006.09 - 2010.06，華中農業大學，農學，本科 / 學士。

工作經歷

2021.03 - 至今，山西農業大學，生命科學學院，生物信息系主任；
2019.12 - 至今，山西農業大學，生命科學學院，副教授；
2017.07 - 2019.11，山西農業大學，生命科學學院，講師。

研究領域

1. 生物信息軟體開發和套用；
2. 植物功能基因組、植物三維基因組；
3. 穀子功能成分、食味品質分子機制和套用研究；
4. 穀子耐鹽鹼分子機制和套用研究。

主講課程

為研究生講授《研究生常用軟體》、《生物學及研究進展》課程；
為本科生講授《Perl語言編程》、《數據挖掘》、《生物信息學前沿》、《資料庫套用》課程。

學術成果

為共一作者（Equal contributors）； * 為通訊作者（Correspondence）:
SCI 論文（第一或通訊）
  1. Yulu Yang, Jinjin Cheng, Huarui Han, Rong Sun, Yajun Li, Yakun Zhang, Yuanhuai Han, Hui Zhang, Xukai Li* (李旭凱). Genome-wide identification of the HKT transcription factor family and their response to salt stress in foxtail millet (Setaria italica). Plant Growth Regulation, 2022, x(x):x. DOI: 10.1007/s10725-022-00903-z. (通訊作者, SCI 期刊論文, 2022.09.22發表, IF: 3.242, 中科院分區: 3區)
  2. Xukai Li (李旭凱), Jianhua Gao, Jingyi Song, Kai Guo, Siyu Hou, Xingchun Wang, Qiang He, Yanyan Zhang, Yakun Zhang, Yulu Yang, Jiaoyan Tang, Hailang Wang, Staffan Persson, Mingquan Huang, Lishuai Xu, Linlin Zhong, Dongqin Li, Yongming Liu, Hua Wu*, Xianmin Diao*, Peng Chen*, Xiaowen Wang*, Yuanhuai Han*. Multi-omics analyses of 398 foxtail millet accessions reveal genomic regions associated with domestication, metabolite traits and anti-inflammatory effects. Molecular Plant, 2022, 15(8):1367-1383. DOI: 10.1016/j.molp.2022.07.003. (第一作者, SCI 期刊論文, 2022.07.08發表, IF: 21.949, 中科院分區: 1區Top, 植物科學頂級期刊)
  3. Yakun Zhang, Jianhua Gao, Qianru Qie, Yulu Yang, Siyu Hou, Xingchun Wang, Xukai Li* (李旭凱), Yuanhuai Han*. Comparative analysis of flavonoid metabolites in foxtail millet (Setaria italica) with different eating quality. Life, 2021, 11(6):578. DOI: 10.3390/life11060578. (通訊作者, SCI 期刊論文, 2021.06.18發表, IF: 3.817, 中科院分區: 3區)
  4. Zhirong Yang, Haoshan Zhang, Xukai Li (李旭凱), Huimin Shen, Jianhua Gao, Siyu Hou, Bin Zhang, Sean Mayes, Malcolm Bennett, Jianxin Ma, Chuanyin Wu, Yi Sui*, Yuanhuai Han*, Xingchun Wang*. A mini foxtail millet with an Arabidopsis-like life cycle as a C4 model system. Nature Plants, 2020, 6(9):1167–1178. DOI: 10.1038/s41477-020-0747-7. (共同第一作者, SCI 期刊論文, 2020.08.31發表, IF: 13.256, 中科院分區: 1區Top, 植物科學頂級期刊)
  5. Renjian Li, Yanqing Han, Qi Zhang, Guorong Chang, Yuanhuai Han, Xukai Li* (李旭凱), Baojun Zhang*. Transcriptome profiling analysis reveals co-regulation of hormone pathways in foxtail millet during Sclerospora graminicola infection. International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21(4):1226. DOI: 10.3390/ijms21041226. (通訊作者, SCI 期刊論文, 2020.02.12發表, IF: 4.183, 中科院分區: 2區Top)
  6. Xukai Li (李旭凱), Kai Guo, Xiaobo Zhu, Peng Chen, Ying Li, Guosheng Xie, Lingqiang Wang, Yanting Wang, Staffan Persson*, Liangcai Peng*. Domestication of rice has reduced the occurrence of transposable elements within gene coding regions. BMC Genomics, 2017, 18(1):55. DOI: 10.1186/s12864-016-3454-z. (第一作者, SCI 期刊論文, 2017.01.09發表, IF: 3.729, 中科院分區: 2區Top)
  7. Xukai Li (李旭凱), Haofeng Liao, Chunfen Fan, Huizhen Hu, Ying Li, Jing Li, Zili Yi, Liangcai Peng, Yuanyuan Tu*. Distinct geographical distribution of the Miscanthus accessions with varied biomass enzymatic saccharification. PLoS ONE, 2016, 11(8):e0160026. DOI: 10.1371/journal.pone.0160026. (第一作者, SCI 期刊論文, 2016.08.17發表, IF: 2.806, 中科院分區:3區，入選ESI高被引論文，截止2021年10月15日被引171次)
中文論文（第一或通訊）
  1. 孫蓉，楊宇琭，李亞軍，張會，李旭凱*. 穀子PLATZ轉錄因子家族的鑑定和分析. 植物學報, 2022, 0(00):00.（通訊作者，國家1A級核心期刊，已接收）
  2. 楊宇琭，羅韶凡，郄倩茹，張雅坤，韓淵懷，李旭凱*，馬芳芳*. 基於Camoco算法挖掘穀子葉鞘和葉枕顏色相關基因. 山西農業大學學報（自然科學版）, 2022, 42(02):12-20.（通訊作者，核心期刊，2022.04.21發表）
  3. 任雪梅，南力彰，李旭凱*. 玉米胚乳醇溶蛋白合成的分子機制研究進展. 山西農業科學, 2021, 49(11):1355-1360.（通訊作者，2021.11.12發表）
  4. 高建華，歐陽春平，錢紅梅，劉小瓊，郭俊佩，趙雄偉，王興春，韓淵懷，李旭凱*，侯思宇*. Comparison of the promoter activity of vip3A gene and cry1Ia gene using IeGFP as a fluorescent reporter. 中國生物化學與分子生物學報, 2021, 37(05):617-626.（通訊作者，國家1A級核心期刊，2021.03.10發表）
  5. 胡萌萌，張麗玲，張雅坤，郄倩茹，任碧雲，侯思宇，朱喆標，高建華，王海崗，李旭凱*，韓淵懷*. 基於WGCNA挖掘穀子澱粉合成相關基因. 山西農業大學學報（自然科學版）, 2021, 41(1):11-19.（通訊作者，核心期刊，2021.01.08發表）
  6. 張麗玲，郄倩茹，羅韶凡，牛文康，朱喆標，高雨柔，李旭凱*，韓淵懷*. 穀子12種黃酮類代謝物合成通路分析. 山西農業大學學報（自然科學版）, 2020, 40(4):10-18.（通訊作者，核心期刊，2020.06.16發表）
  7. 李旭凱，胡萌萌，張義茹，姜金霞，韓淵懷*. 基於米色、轉錄分析探究穀子食味差異. 山西農業大學學報（自然科學版）, 2019, 39(5):1-9.（第一作者，核心期刊，2019.06.24發表）
  8. 李旭凱，李任建，張寶俊*. 利用WGCNA鑑定非生物脅迫相關基因共表達網路. 作物學報, 2019, 45(9):1349-1364.（第一作者，國家1A級核心期刊，2019.04.18發表，入選中國知網優秀中文文章，並全文翻譯成英文在國際上宣傳推廣）
  9. 李旭凱*，王釔傑，王俊傑. Enrich_analysis.pl, 差異表達基因富集分析的perl腳本. 生物信息學, 2018, 16(3):178-183.（第一作者，2018.09.15發表）
  10. 李旭凱，彭良才，王令強*. pep_pattern.pl, 搜尋蛋白質序列模體的perl腳本. 華中農業大學學報（自然科學版）, 2014, 4:1-6.（第一作者，核心期刊，2014.06.10發表）
  11. 李旭凱，郭凱，彭良才，王令強*. ChooseMaterials.pl, 控制變數挑選實驗材料的perl腳本. 生物信息學, 2013, 11(3):186-191.（第一作者，2013.09.15發表）
參與的論文
  1. Jiaoyan Tang, Xukai Li (李旭凱), Yakun Zhang, Yulu Yang, Rong Sun, Yajun Li, Jianhua Gao, Yuanhuai Han*. Differential Flavonoids and Carotenoids Profiles in grains of six Poaceae Crops. Foods, 2022, 11(14):2068. DOI: 10.3390/foods11142068. (SCI 期刊論文, 2022.07.12發表, IF: 5.561, 中科院分區: 2區)
  2. Guofang Xing, Minshan Jin, Ruifang Qu, Jiewei Zhang, Yuanhuai Han, Yanqing Han, Xingchun Wang, Xukai Li (李旭凱), Fangfang Ma*, Xiongwei Zhao*. Genome-wide investigation of histone acetyltransferase gene family and its responses to biotic and abiotic stress in foxtail millet (Setaria italica [L.] P. Beauv). BMC Plant Biology, 2022, 22(1):292. DOI: 10.1186/s12870-022-03676-9. (SCI 期刊論文, 2022.06.14發表, IF: 5.260, 中科院分區: 2區)
  3. Qianxiang Zhang, Yaofei Zhao, Jinli Zhang, Xukai Li (李旭凱), Fangfang Ma, Ming Duan, Bin Zhang*, Hongying Li*. The responses of the lipoxygenase gene family to salt and drought stress in foxtail millet (Setaria italica). Life, 2021, 11(11):1169. DOI: 10.3390/life11111169. (SCI 期刊論文, 2021.11.02發表, IF: 3.817, 中科院分區: 3區)
  4. Guifen Zhang, Lingqiang Wang*, Xukai Li (李旭凱), Shuming Bai, Yali Xue, Zihui Li, Shang-wen Tang, Yanting Wang, Youmei Wang, Zhen Hu, Ping Li, Liangcai Peng*. Distinctively altered lignin biosynthesis by site‐modification of OsCAD2 for enhanced biomass saccharification in rice. Global Change Biology Bioenergy, 2021, 13:305-319. DOI: 10.1111/gcbb.12772 . (SCI 期刊論文, 2020.10.26發表, IF: 5.316, 中科院分區: 1區Top)
  5. Jiajia Li, Xukai Li (李旭凱), Ahmed Adel Khatab, Guosheng Xie*. Phylogeny, structural diversity and genome-wide expression analysis of fibrillin family genes in rice. Phytochemistry, 2020, 175:112377. DOI: 10.1016/j.phytochem.2020.112377. (SCI 期刊論文, 2020.04.18發表, IF: 2.905, 中科院分區: 2區)
  6. Huizhen Hu, Ran Zhang, Zhangsheng Tao, Xukai Li (李旭凱), Yuyang Li, Jiangfeng Huang, Xinxin Li, Xiao Han, Shengqiu Feng, Guimin Zhang, Liangcai Peng*. Cellulose synthase Mutants distinctively affect cell growth and cell wall integrity for plant biomass production in Arabidopsis. Plant and Cell Physiology, 2018, 59(6):1144-1157. DOI: 10.1093/pcp/pcy050/4921018. (SCI 期刊論文, 2018.03.05, IF: 4.817, 中科院分區: 2區)
  7. Youmei Wang, Chaoqun Pang, Xukai Li (李旭凱), Zhen Hu, Zhengyi Lv, Bo Zheng, Peng Chen*. Identification of tRNA nucleoside modification genes critical for stress response and development in rice and Arabidopsis. BMC Plant Biology, 2017, 17(1):261. DOI: 10.1186/s12870-017-1206-0. (SCI 期刊論文, 2017.12.21發表, IF: 3.964, 中科院分區: 2區)
  8. Chunfen Fan, Shengqiu Feng, Jiangfeng Huang, Yanting Wang, Leiming Wu, Xukai Li (李旭凱), Lingqiang Wang, Tao Xia, Jingyang Li, Xiwen Cai, Liangcai Peng*. AtCesA8-driven OsSUS3 expression leads to largely enhanced biomass saccharifcation and lodging resistance by distinctively altering lignocellulose features in rice. Biotechnology for Biofuels, 2017, 10:221. DOI 10.1186/s13068-017-0911-0. (SCI 期刊論文, 2017.09.16發表, IF: 6.732, 中科院分區: 1區Top)
  9. Youmei Wang, Dongqin Li, Junbao Gao, Xukai Li (李旭凱), Rui Zhang, Xiaohuan Jin, Zhen Hu, Bo Zheng, Staffan Persson, Peng Chen*. The 2'-O-methyladenosine nucleoside modification gene OsTRM13 positively regulates salt stress tolerance in rice. Journal of Experimental Botany, 2017, 68(7):1479-1491. DOI: 10.1093/jxb/erx061. (SCI 期刊論文, 2017.03.28發表, IF: 6.538, 中科院分區: 2區Top)
  10. Fengcheng Li, Guosheng Xie, Jiangfeng Huang, Ran Zhang, Yu Li, Miaomiao Zhang, Yanting Wang, Ao Li, Xukai Li (李旭凱), Tao Xia, Chengcheng Qu, Fan Hu, Arthur Ragauskas, Liangcai Peng*. OsCESA9 conserved-site mutation leads to largely enhanced plant lodging resistance and biomass enzymatic saccharification by reducing cellulose DP and crystallinity in rice. Plant Biotechnology Journal, 2017, 15(9):1093-1104. DOI: 10.1111/pbi.12700. (SCI 期刊論文, 2017.03.15發表, IF: 7.443, 中科院分區: 1區Top)
  11. Yang Wang, Xukai Li (李旭凱), Kai Guo, Liangcai Peng, Yanting Wang*. Gene profling of plant cell wall biosynthesis for genetic enhancing biomass enzymatic saccharifcation in cereal crops. Journal of Plant Biochemistry & Physiology, 2017, 5:179. DOI: 10.4173/2329-9029.1000179. (期刊論文, 2017.01.19發表)
  12. 郄倩茹，胡萌萌，張麗玲，張雅坤，李旭凱，韓淵懷*，楊宏斌*. 小米油脂成分含量與小米粥感官品質的相關性. 中國農業大學學報（自然科學版）, 2021, 26(04):38-46.（國家1B級核心期刊，2021.03.09發表）
  13. 趙雄偉，吳年隆，喬佳輝，李旭凱，韓淵懷，邢國芳*. 穀子酸性磷酸酶ACP家族基因鑑定與SiACP1耐低磷單倍型分析. 華北農學報, 2020, 35(4):35-45.（核心期刊，2020.08.28發表）
  14. 李任建，申哲源，李旭凱，韓淵懷，張寶俊*. 穀子NBS-LRR類基因家族全基因組鑑定及表達分析. 河南農業科學, 2020, 49(02):34-43.（核心期刊，2019.12.11發表）
  15. 易曉燕，李豐成，郭凱，張冉，李旭凱，王友梅，彭良才，謝國生*. 水稻半纖維素支鏈合酶GT61家族基因的結構特徵和組織表達分析. 中國農業大學學報（自然科學版）, 2015, 20(1):19-28.（核心期刊，2015.02.15發表）
  16. 陳婷婷，李旭凱，王如意，彭良才，夏濤*. 棉花GhPME1和GhPME2基因的克隆和表達分析. 中國農業大學學報（自然科學版）, 2012, 17(5):7-14.（核心期刊，2012.10.15發表）

主持科研項目

1. 國家自然科學基金青年科學基金項目，基於GWAS與基因共表達網路的穀子耐鹽鹼基因發掘及其功能研究，項目編號32001608，研究年限2021年01月-2023年12月，24萬元.
2. 山西省套用基礎研究面上青年基金項目，項目編號201901D211362，穀子耐鹽鹼品種篩選與關鍵基因定位，研究年限2019年09月-2022年09月，3萬元.
3. 山西省優秀博士來晉工作獎勵資金科研項目，生物信息軟體開發與晉谷21籽粒發育時期轉錄組探究，項目編號SXYBKY201738，研究年限2018年01月-2019年12月，5萬元.
4. 山西農業大學科技創新基金項目，小米代謝物差異與食味品質的關係，項目編號2017YJ27，研究年限2017年07月-2020年07月，14萬元.

參與科研項目

1. 國家重點研發計畫項目子課題，穀子氮素高效吸收利用的分子機制，研究年限2018年7月-2022年12月.
2. 國家自然科學基金面上項目，小麥脆稈基因的圖位克隆和功能解析，研究年限2018年01月-2021年12月.
3. 國家自然科學基金面上項目，一個新的C2H2型鋅指蛋白PhZFP1調控矮牽牛耐寒性的機理研究，研究年限2018年01月-2021年12月.
4. 國家自然科學基金面上項目，楊樹Elp基因影響ncm5U生物合成和參與乾旱耐受的功能分析，研究年限2014年01月-2017年12月.
5. 國家自然科學基金面上項目，楊樹轉錄延伸複合體Elp基因參與乾旱耐受的分子機制，研究年限2013年01月-2015年12月.

獲獎榮譽

  1. 2016年08月在《PLoS ONE》上發表的 SCI 論文入選ESI高被引論文，截止2021年10月15日被引171次.
  2. 2019年04月在《作物學報》上發表的國家1A級核心期刊論文入選中國知網優秀中文文章，並全文翻譯成英文在國際上宣傳推廣.
  3. 華中農業大學2016-2017學年度優秀博士學位論文，2018年01月公布.
  4. 2018年度“五四青年標兵”稱號，2019年05月公布.
  5. 山西農業大學生命科學學院2020年教職工年度考核優秀.
  6. “兩優一先” 2020-2021年度優秀黨務工作者，2021年06月公布.
  7. 山西農業大學生命科學學院2021年教職工年度考核優秀.

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