《RNA編輯調控的生物信息學與功能基因組學研究》是李川昀為項目負責人，北京大學為依託單位的面上項目。
基本介紹
- 中文名：RNA編輯調控的生物信息學與功能基因組學研究
- 項目類別 ：面上項目
- 依託單位 ：北京大學
- 項目負責人：李川昀
科研成果 ,項目摘要,
科研成果
序號 | 標題 | 類型 | 作者 |
|---|---|---|---|
1 | Isoform Evolution in Primates through Independent Combination of Alternative RNA Processing Events | 期刊論文 | Zhang, Shi-Jian(#); Wang, Chenqu(#); Yan, Shouyu; Luan, Xuke; Li, Yumei; Shen, Qing Sunny; Zhong, Xiaoming; Chen, Jia-Yu; He, Aibin; Wang, Xiangfeng; Luan, Xuke; Fu, Aisi; Tan, Bertrand Chin-Ming; Li, Chuan-Yun(*) |
2 | 在恆河猴基因組學框架下研究人類演化與調控 | 期刊論文 | 鐘曉明(#); 申晴; 彭繼光; 李玉梅; 李川昀(*) |
3 | Selectively Constrained RNA Editing Regulation Crosstalks with piRNA Biogenesis in Primates | 期刊論文 | Yang, Xin-Zhuang(#); Chen, Jia-Yu(#); Liu, Chu-Jun; Peng, Jiguang; Wee, Yin Rei; Han, Xiaorui; Wang, Chenqu; Zhong, Xiaoming; Shen, Qing Sunny; Liu, Hsuan; Cao, Huiqing; Chen, Xiao-Wei; Tan, Bertrand Chin-Ming(*); Li, Chuan-Yun(*) |
4 | Human exonization through differential nucleosome occupancy | 期刊論文 | Li, Yumei(#); Li, Chen(#); Li, Shuxian; Peng, Qi; An, Ni A.; He, Aibin(*); Li, Chuan-Yun(*) |
5 | RhesusBase PopGateway: Genome-Wide Population Genetics Atlas in Rhesus Macaque | 期刊論文 | Zhong, Xiaoming(#); Peng, Jiguang(#); Shen, Qing Sunny(#); Chen, Jia-Yu; Gao, Han; Luan, Xuke; Yan, Shouyu; Huang, Xin; Zhang, Shi-Jian; Xu, Luying; Zhang, Xiuqin; Tan, Bertrand Chin-Ming; Li, Chuan-Yun(*) |
6 | Evolutionarily significant A-to-I RNA editing events originated through G-to-A mutations in primates. | 期刊論文 | An Ni A(#); Ding Wanqiu(#); Yang Xin Zhuang(#); Peng Jiguang; He Bin Z; Shen Qing Sunny; Lu Fujian; He Aibin; Zhang Yong E; Tan Bertrand Chin Ming; Chen Jia Yu(*); Li Chuan Yun(*) |
7 | Emergence, Retention and Selection: A Trilogy of Origination for Functional De Novo Proteins from Ancestral LncRNAs in Primates | 期刊論文 | Chen, Jia-Yu(#); Shen, Qing Sunny(#); Zhou, Wei-Zhen(#); Peng, Jiguang; Li, Yumei; Liu, Chu-Jun; Luan, Xuke; Ding, Wanqiu; Li, Shuxian; He, Bin Z.; Luan, Xuke; Chen, Chunyan; Zhang, Yong E.; Tan, Bertrand Chin-Ming; He, Aibin(*); Li, Chuan-Yun(*) |
項目摘要
RNA編輯可引起基因組與其編碼的轉錄組在特定位點的序列差異，對生命科學多領域的研究產生深遠影響。新一代測序技術的出現加速了對RNA編輯調控的鑑定和理解，然而，受樣本取材、數據分析等因素限制，目前對這一調控層次的整體組學模式、分子決定機制及進化與功能性認識仍處在起步階段。本課題擬在前期工作基礎上，利用恆河猴作為模式動物和人類近緣物種的雙重優勢，運用新一代測序技術，鑑定並分析恆河猴多個體、多組織、多發育階段、多疾病狀態下的RNA編輯組，完善對該調控層次組學模式的認識。同時，擬從ADAR 順式與反式調控、RNA二級結構穩定性等角度，闡釋上述RNA編輯組形成的分子機制。最後，擬結合人類、黑猩猩等多物種的RNA編輯組數據，並輔以分子生物學實驗驗證，從功能基因組學和分子演化的角度，系統研究RNA編輯調控的整體功能，探索RNA編輯與其他生物調控的關聯性，為RNA編輯調控的功能研究與轉化醫學套用提供依據。
