長鏈非編碼lncRNA-00673在非小細胞肺癌中的功能和機制研究

《長鏈非編碼lncRNA-00673在非小細胞肺癌中的功能和機制研究》是依託復旦大學,由於慧擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:長鏈非編碼lncRNA-00673在非小細胞肺癌中的功能和機制研究
  • 依託單位:復旦大學
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:于慧
項目摘要,結題摘要,

項目摘要

長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)作為一類新的調控性非編碼RNA,在非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)中的存在情況、功能機制和臨床意義還不清楚。課題組前期通過生物信息學和數據分析,從全基因組表達譜數據中挖掘與NSCLC有關的長鏈非編碼RNA的表達信息,篩選出770個具有顯著表達差異的lncRNAs;其中,lncRNA-00673作為差異表達最為顯著的上調基因,引起我們的關注。進一步,我們通過定量RT-PCR在獨立樣本中證實lncRNA-00673在NCSLC組織中表達顯著上調,並且初步功能實驗發現lncRNA-00673具有促進肺癌細胞的遷移和侵襲作用。本項目將基於前期基礎上,進一步闡明lncRNA-00673在NSCLC發生髮展過程中的功能和作用機制,並探討其臨床意義,為NSCLC的發病機制提供新的思路。

結題摘要

KRAS基因突變是目前肺腺癌中第二大明確的驅動基因,突變頻率在15-30%,但針對KRAS突變至今仍沒有有效的治療策略。Meta分析表明,在非小細胞肺癌尤其在腺癌的組織學類型中,具有KRAS基因突變的患者預後較差。最近的研究顯示,KRAS突變的肺腺癌可以分為三種亞型:KL 亞型 (LKB1/STK11突變), KP 亞型 (TP53突變), KC 亞型 (TTF-1陰性),分別占到總數的44%, 34% and 22%。我們通過TCGA 癌症資料庫和復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫55例的獨立樣本進行驗證,首次證實再生基因家族成員之一REG4幾乎僅表達在KRAS突變的肺腺癌,並且在 NKX2-1 (TTF1) 低表達的 KC 型亞組的表達量顯著高於 TTF1陽性的 KP 和 KL 組。由於KC型肺癌是一種具有胃上皮分化特徵的特殊亞型,而 REG4 是一種與胃腸道腫瘤密切相關的基因,兩者的特徵高度契合,提示 REG4 可能在 KC 型肺腺癌具有重要作用,值得深入研究。本課題旨在闡明 REG4 在NSCLC,尤其是在 KRAS 突變合併 TTF1 低表達的 KC 型肺腺癌中的作用和分子機制,為 NSCLC的治療和預後提供新的生物標誌物和治療靶點。

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