《非小細胞肺癌相關LncRNAs的發現及其對靶向mRNAs的調控》是依託上海交通大學，由姜麗岩擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：非小細胞肺癌相關LncRNAs的發現及其對靶向mRNAs的調控
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：姜麗岩
- 依託單位：上海交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
肺癌是目前中國以及世界範圍內最常見的惡性腫瘤，其中非小細胞肺癌更是在近幾年增長迅速，因此研究其發病機制和發現早期診斷標誌物具有重要意義。非編碼RNA 參與了多種疾病尤其是腫瘤發生髮展的調控過程，前期我們通過對非小細胞肺癌癌和癌旁組織全基因組表達譜數據的分析，發現一組在非小細胞肺癌中顯著差異表達的LncRNAs。並且通過生物信息學預測，推斷LncRNA-a可能是通過cis作用元件、LncRNA-b和LncRNA-c通過聯合轉錄因子/染色質修飾複合物的機制靶向調控特定的mRNAs從而影響非小細胞肺癌的增殖凋亡、侵襲轉移等惡性行為。本課題擬通過相關分子生物學實驗探討LncRNA-a,b,c如何通過上述作用方式，實現對mRNAs靶向調控，從而在非小細胞肺癌的發生髮展過程中起到調控作用。最後，將在較大量的臨床樣本中鑑定LncRNA-a,b,c對非小細胞肺癌的診斷、治療以及預後的臨床意義。
結題摘要
非小細胞肺癌（NSCLC）是在近幾年發病率及死亡率增長迅速，因此研究其發病機制和發現早期診斷標誌物具有重要意義。非編碼RNA參與了多種疾病尤其是腫瘤發生髮展的調控過程，前期我們通過對非小細胞肺癌癌和癌旁組織 全基因組表達譜數據的分析，發現一組在非小細胞肺癌中顯著差異表達的LncRNAs。並且通過生物信息學預測，推斷它們能影響非小細胞肺癌的增殖凋亡、侵襲轉移等惡性行為。本課題在前期晶片實驗結果中發現於NSCLC中顯著高表達的長鏈非編碼RNA對NSCLC的增殖和轉移具有重要作用的基礎上，以lncRNA-34487為中心，全面探討lncRNA-344887相互作用蛋白以及與下游靶分子之間的網路調控關係。課題組發現lncRNA-344887在NSCLC組織及NSCLC細胞系中呈顯著高表達，且與臨床預後差相關。隨後，課題組採用NSCLC細胞系H1299和H1975缺氧暴露實驗發現lncRNA-344887表達水平在缺氧環境中明顯升高，且呈時間依賴性。生物信息學預測及分子生物學實驗表面lncRNA-34487在轉錄水平上受到HIF-1a調控；且NMRAL2P是HIF-1a的靶基因。體外實驗表明lncRNA-344887對NSCLC增殖、侵襲、遷移能力的促進作用；體內實驗表明lncRNA-344887能增強體內NSCLC細胞轉移的能力。隨後，我們通過RNA-seq分析發現lncRNA-344887通過正向調控PHGDH表達調控細胞增殖。課題組通過綜合利用高通量技術及生物信息學分析、體內外功能實驗、臨床樣本檢測及統計分析等手段，闡述了lncRNA-344887作為NSCLC新型生物分子標記物的套用潛力。缺氧是實體惡性腫瘤的重要特徵，能促進惡性腫瘤表型的發生。我們的研究結果首次揭示了缺氧微環境相關的lncRNA-344887在促進NSCLC增殖及轉移方面的作用及分子機制。這些研究結果不僅能幫助理解非編碼RNA在腫瘤缺氧微環境中促進腫瘤表型發生中的作用，且能對NSCLC預後及個體化診治提供基礎實驗依據。
