醫院管理實踐是一個系統化的運行過程。這個過程也是一個不斷總結經驗、教訓的過程。
醫療改革之前，我國的醫療資源缺乏，“三難四少”——看病難、住院難、手術難，醫療機構少、醫護人員少、醫院床位少、醫療設備少，成了當時醫療狀況的寫照。為改變這種狀況，國家確立了市場化的改革方向，鼓勵社會資本進入醫療領域。醫改的市場化方向，結果導致了患者醫療成本的大幅度上升，看病難、看病貴又成為了醫改過程中的又一新問題。政府對醫院的補償機制，即使政府不堪重負，也無法從根本上解決這一問題。2005年的醫院管理年活動，是醫療改革史上的一件大事，意味著醫療管理在醫院實踐工作中越來越受到重視。向管理要效益，降低醫院的運營成本，是醫院走出困境的不二之路。
儘管這些年的醫改促使我們的醫院管理水平有所提升，但我們同時也應該認識到我國醫院管理工作中還存在的問題，主要表現在：（一）醫院管理模式尚未適應現代醫學模式的轉變，重醫輕防、醫防分離的錯誤做法仍未從根本上得到糾正；（二）醫院領導體制上仍存在黨政不分、政醫不分、領導班子素質參差不齊等問題；（三）醫院在人事制度上的“鐵飯碗”問題、人才培養和流動問題還存在不少弊端；（四）分配體制上“大鍋飯”和不體現按勞取酬的問題，少數醫院“灰色收入”的問題，嚴重影響部分醫務人員的積極性；（五）醫院性質、收費標準和國家主渠道之間的矛盾問題，從理論到實踐上都尚未理順；（六）經營管理既存在薄弱的一面，同時也存在不合理收費和看病貴的問題，已成為社會關注的熱點之一；（七）行業風氣和職業道德建設方面存在的問題尚未從根本上得到解決；（八）在醫院管理方面普遍存在醫院管理理論落後於管理實踐，管理理念又落後於管理理論的狀況，醫院管理隊伍專業化的道路仍然比較遙遠；（九）醫療質量上存在問題較多，學科帶頭人的培養和技術建設方面與國外先進醫院的差距較大；（十）醫療法律尚未完善，在醫療糾紛處理方面存在的法津適用和處理辦法的矛盾突出。
