酶工程方法是以現代酶學、生物學(包括生物化學、微生物學、遺傳學及分子生物學)的理論知識為基礎,並結合化學工程、電子計算機等領域的最新成就,將酶有效地套用於生產實踐的一門技術體系。包括酶的生產、製備與套用三個部分,近十幾年來,酶工程技術的發展十分迅速,酶的套用形式正在逐漸演變,從溶液酶、菌體到固定化酶、固定化菌體,近來人們正致力於開發固定化生長菌體、固定化多酶系統(包括輔酶的固定化與再生產)、以及酶一菌體共固定化系統的套用。酶反應器是酶的套用形式與一定的工藝流程組成的實際套用體系。目前新的反應器形式正在開發,酶—膜反應器正逐漸推廣套用。