5月8日,毛澤東在中央政治局會議上說,重慶國民黨方面要劉為章同周恩來談話,說明日軍發動新的軍事進攻,要求我們在軍事上配合。會議決定由毛澤東起草復周恩來電。同日,毛澤東在為中共中央書記處起草的復周恩來電中指出“(一)對於敵軍進攻,須強調‘全國人民團結起來反對日本帝國主義進攻’的號召。(二)對於國民黨要求我們配合作戰,須告以當然如此,不成問題。(三)我們要求事項:(甲)速解決新四(軍)問題;(乙)速發餉彈;(丙)停止反共;(丁)派機送周回延開會。”
5月9日,毛澤東等致電八路軍、新四軍各部領導人,提出我軍在配合國民黨作戰中的方針:仍按我軍現在姿態,鞏固各根據地,耐心發展敵偽奸三種工作(這是極重要的),按當地情況許可,拔取敵偽某些深入我區的據點;在接近豫陝地區,應有相應部隊配合友軍作戰,並極力發展統戰工作,但不要乘機向國民黨地區擴展,使蔣桂各軍放心對敵。次日,毛澤東致電周恩來:“已電總部擬具配合中央軍作戰計畫,惟新四、餉彈、反共三大問題,請蔣速予解決。”
為在戰役中減輕蔣介石對我恐懼起見,毛澤東於5月12日致電陳毅、劉少奇:在蔣介石令何柱國襲擊隴海線,擾敵後路時,令彭雪楓、鄧子恢所部,不要越過津浦線以西,仍在原地不動;令張雲逸、羅炳輝所部不要擾擊李品仙。
5月14日,毛澤東在致彭德懷的電報中,再次強調我們的基本方針是團結對敵,是配合作戰。並提出在周密考慮情況下,給以有計畫的配合,主要配合區域是晉東南和冀南,其他作為次要配合區域(即按尋常狀態作戰)。
當時有訊息說日軍沿黃河增兵甚多,揚言渡河。又傳敵於日前由平民搶渡,沿河民眾甚為恐慌,西安糧價亦猛漲,正在疏散,人心惶惶。毛澤東在5月14日致彭德懷的另一封電報中,認為“我軍於此時有在敵側背給以打擊以振奮國民黨之必要”。
5月26日,毛澤東在致周恩來的電報中指出:“衛立煌對我積極配合作戰甚為興奮。”
5月30日,毛澤東電告彭德懷:“九個月來中央社第一次廣播我軍戰績,謂據洛陽訊,我軍又截斷正太路,車不通等語。”
但是,日本在發動中條山戰役的同時發動了謠言攻勢,誣衊共產黨和八路軍。5月25日,毛澤東在他起草的中共中央關於揭破遠東慕尼黑新陰謀的通知中,揭破謠言,指出事實上“新四軍雖被宣布為‘叛軍’,八路軍雖沒有領到一顆彈一文餉,然無一刻不與敵軍搏鬥。此次晉南戰役,八路軍復自動配合國民黨軍隊作戰”。“共產黨領導的武力和民眾已成了抗日戰爭中的中流砥柱。一切對於共產黨的污衊,其目的都在使抗戰失敗,以利投降。我們應發揚八路軍新四軍的戰績,反對一切失敗主義者和投降主義者”。