過敏的傳統定義是“任何有關免疫系統的異常或病理反應”。免疫系統是身體的天然防線，能夠自動針對它不喜歡的物質產生某種標記性物質。傳統的“標記”就是一種叫做IgE的抗體（免疫球蛋白E）。這種抗體附著在 “肥大細胞”（mast cell）上。一旦不合適的食物，即過敏物，接觸到抗體後，IgE分子就牢牢鎖住過敏物質，並刺激肥大細胞釋放出一種含有組胺和其他化學物質的顆粒，從而引發常見的過敏反應—皮疹、發燒、鼻炎、鼻竇炎、哮喘、濕疹以及其他一些嚴重的反應。
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食物過敏主要因素
現在醫學界發現，大多數過敏反應和不耐性並不完全是由IgE引發的，另一種標記物質IgG同樣也有這樣的作用。約克營養實驗室的詹姆斯·布拉利醫生一直致力於IgG實驗研究，他認為，食物過敏非常常見，而且過敏反應不僅僅局限於呼吸道、皮膚及消化道；很多過敏反應都是遲發的，短則一小時，長則三五天，而且這種遲發反應通常很難察覺。遲髮型食物過敏通常表現為消化道無法阻擋半消化或未消化物質進入血液循環。這並不是什麼新理論，早在1950年，一些過敏學領域的先驅如塞倫·倫道夫醫生、赫伯特·林克爾醫生、阿瑟·古柯醫生等人就曾提出類似理論。近年，威廉·菲爾波特醫生和馬歇爾·曼德爾醫生也曾經撰文論述遲髮型過敏反應會給全身各個系統帶來深遠影響。
很多食物，即使不是大多數，都不是立即就引發過敏反應，而是逐漸積累、延遲發作。這一理論已經得到大多數人的認同。當然，遲髮型過敏反應僅僅通過觀察是難以察覺的。IgE抗體反應通常很迅速，而IgG抗體則是引發大多數慢性食物過敏的主要因素。
過敏反應
免疫學專家喬納森·布羅托夫醫生認為，某些被消化的物質會刺激身體分泌組胺，它是一種可以對頭腦健康產生長期影響的神經遞質，即使沒有IgE參與也會引發一些傳統的過敏反應。含有這類物質的食物有貝類、蟹、西紅柿、豬肉、酒精、朱古力、鳳梨、木瓜、蕎麥、葵花子、芒果、芥末和含有凝集素的食物，如花生。
如果血液內的過敏原刺激細胞分泌大量抗體（主要是IgG），體細胞和腦細胞便會產生免疫複合物，身體也會發生過敏反應。“過敏反應是由於免疫複合物數量過多才引發的，這些免疫複合物就像血液內的垃圾一樣。” 布羅托夫這樣認為。而吞噬細胞會清除這些垃圾，就像一個忠實的管道清潔工。但如果管道內垃圾過多，吞噬細胞便無法出色地完成清除工作了。
