蛋白質複合物晶體結構線站實驗站是一種用於化學、生物學、農學、藥學領域的分析儀器,於2014年12月1日啟用。
基本介紹
- 中文名:蛋白質複合物晶體結構線站實驗站
- 產地:中國
- 學科領域:化學、生物學、農學、藥學
- 啟用日期:2014年12月1日
- 所屬類別:分析儀器 > X射線儀器 > X射線衍射儀
蛋白質複合物晶體結構線站實驗站是一種用於化學、生物學、農學、藥學領域的分析儀器,於2014年12月1日啟用。
蛋白質複合物晶體結構線站實驗站是一種用於化學、生物學、農學、藥學領域的分析儀器,於2014年12月1日啟用。技術指標光束線設計主要指標: ►能量分辨: ≤ 2×10-4 ►樣品處光通量: ≥1×1012 phs/s (1...
蛋白質微晶體結構線站實驗站是一種用於生物學、藥學領域的分析儀器,於2014年12月1日啟用。技術指標 光子能量範圍:5~18keV,能量分辨:2×10-4(@12keV),樣品處光通量:2×1011phs/s(12keV@300mA),聚焦光斑尺寸:25×15m2(@12keV),光束髮散角:0.7×0.25 mrad2(@12keV)(H×V)。主要功能 生物...
2.4多種體系蛋白質表達模組32 2.5大規模蛋白質純化模組49 2.6蛋白質性質表征模組52 2.7自動化結晶和觀察模組53 參考文獻56 第3章蛋白質晶體結構分析系統57 3.1科學目標與建設目標57 3.2系統構成與系統設計59 3.3蛋白質微晶體結構線站(BL18U1)60 3.4蛋白質複合物晶體結構線站(BL19U1)83 3.5高...
其中將依託上海光源,建設蛋白質三維結構測定、蛋白質結構的動態過程研究和功能成像分析等5條光束線、6個實驗站。上海設施將通過系統功能結合與互補,強化規模化蛋白質製備能力、多尺度結構分析能力、多層次動態研究能力、整體與定量分析能力和資料庫與計算能力等蛋白質科學的五種研究能力。上海設施總建築面積33550平方米...
在PSB框架下,EMBL格勒諾布爾分站不僅建設了專門用於解析海量蛋白質結構、功能和結晶的基礎設施和設備,還與ILL合作,成立了生物分子氘化實驗室D-Lab。中子光源在生物學研究方面的巨大優勢是可“目擊”氫原子,而同步輻射的X射線很難檢測。大分子結構與功能之間的關係錯綜複雜,從作為單一原子存在時的生物功能,到作為一...
在本項目開始執行的第一年(2010),國外兩個研究小組分別在Journal of Immunology和PNAS上發表了鼠源RANKL與受體RANK胞外結構域複合物的晶體結構,因此我們將研究重點放在了RANKL和誘餌受體OPG複合物的結構研究。通過近兩年的努力,我們在國際上首次報導了人源RANKL與其誘餌受體OPG複合物的晶體結構,結合生化和細胞...
本項目主要開展果蠅或人Hippo信號通路中重要複合物Merlin-Kibra的結構與功能研究,其中人源Merlin被稱為NF2,Kibra被稱為KIBRA。在前期工作中,我們用酵母雙雜交實驗證明NF2與KIBRA的結合區域主要在KIBRA螺旋區(431-660aa),不能檢測到它們與Expanded結合。我們得到了接近全長的NF2(18-595aa)蛋白,篩選和最佳化出NF2-...
同時解析這些蛋白質複合物的晶體結構,闡明它們的相互作用機制及線上蟲體內的功能,了解這一蛋白質複合物是如何調節線蟲性別決定的。此外本研究還將對TRA-1通過部分降解形成截短形式蛋白的過程進行實驗探索。這些研究將對TRA-1蛋白水平調控的通路進行進一步的補充,為線蟲性別決定通路的完善作出貢獻。結題摘要 秀麗線蟲有...
《轉錄因子結合蛋白Pirin及其複合物的晶體結構測定》是依託清華大學,由馬克·巴特拉姆擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 Pirin是一個高度保守的功能未知的蛋白質家族,在哺乳動物,植物,放線菌,甚至原核生物中都存在它的成員,並且它還是Cupin超家族的一個成員。它是一個與轉錄因子NFI/CTF1(nuclear factor I/...
結構生物學的發展經過以下幾個階段:結構生物學起源於上世紀五十年代眾所周知的Waston Crick 發現DNA雙螺旋結構,建立DNA的雙螺旋模型。60年代當時的開文迪許實驗室的M.Perutz J.Kendrew用X-射線晶體衍射技術獲得了球蛋白的結構。由於X射線晶體衍射技術的套用,使我們可以在晶體水平研究大分子的結構,在分子原子基礎上...
本項目圍繞葉綠體分裂裝置如何定位和組裝這一核心問題,擬對該過程中關鍵蛋白質複合物的結構與功能進行研究,通過解析其結構並結合體內和體外實驗,闡明葉綠體分裂裝置的定位、膜錨定以及在膜間隙中的信息傳遞等過程的分子機制。這些研究將在蛋白質結構水平上幫助我們理解葉綠體分裂裝置,奠定葉綠體分裂過程的分子基礎。結題...
本項目將利用蛋白質晶體學等方法,測定人UBE1DC1及其分別與類泛素分子SUMO-2或Ufm1交聯後蛋白質複合物的晶體結構,分析其與這兩種類泛素分子的結合方式和類泛素化前後結構的差異,探討UBE1DC1活化類泛素分子特別是能同時活化兩種類泛素分子的分子機制,為UBE1DC1活化的類泛素化過程的深入研究奠定基礎,進而加深人類對...
因此我們擬採用分子生物學與生物化學的方法,分別表達、純化和最佳化INAD與TRP蛋白的相互作用區域,用分析型超速離心技術測定兩者相互作用的結合常數,然後以X射線衍射的方法解析INAD/TRP蛋白複合物的晶體結構,最後通過一系列定點突變實驗來驗證該結構的準確性。通過解析INAD/TRP蛋白複合物結構,本課題組將有望發現一種新...
由研究蛋白質結構而發展起來了結構生物學,採用了包括X射線晶體學、核磁共振等技術來解析蛋白質結構。一定數量的殘基對於發揮某一生物化學功能是必要的;40-50個殘基通常是一個功能性結構域大小的下限。蛋白質大小的範圍可以從這樣一個下限一直到數千個殘基。估計的蛋白質的平均長度在不同的物種中有所區別,一般約為...
為了更好地資源配置和提高研究效率,我們在本實驗室建立了bc1複合物抑制劑離體篩選和動力學表征等方法之後,就直接與南方農藥創製中心(浙江省化工研究院)合作,開展化合物的殺菌活性測試。這樣就避免重複性建設和資源的浪費。期間,基於已經報導的蛋白質複合物的晶體結構,本項目對三種代表性的bc1複合物Qo位點抑制劑(...
(7)質量監控電子顯微鏡:用於檢測樣本的同質性,確定蛋白質的聚合程度等。3.全自動蛋白質結晶平台 該平台只向格勒諾布爾科學界開放。2002年8月開始運行,至今已經為諸多實驗室解析了500多種蛋白質和蛋白質複合體。IBS與歐洲分子生物實驗室(EMBL)格勒諾布爾分站開展了有關高流量蛋白自動結晶的合作。4.結構和動力學...
利用蛋白配體結合作用分塊計算,我們實現了基於高精度第一性原理計算的蛋白配體結合能計算和蛋白配體結合構象預測。在碳酸酐酶、HIV-1蛋白酶、胰蛋白酶、CDK2和MCL1等代表性靶標的約400個蛋白-抑制劑複合物晶體結構以及CASF2016和Astex標準測試集上的測試表明蛋白配體結合作用分塊計算用於結合能計算所得結果與實驗值...
我們前期的研究解析了人源TET2與DNA(5mC)複合物的晶體結構(Cell,2013)。進一步研究發現,TET蛋白對三種DNA底物(5mC, 5hmC, 5fC)有明顯的活性差異,就是對5mC的活性很高,而對5hmC,5fC的活性很低。酶活動力學實驗進一步證明TET蛋白對5mC-DNA活性遠遠高於5hmC-/5fC-DNA。我們解析了TET2與5hmC-DNA (...
本項目針對Paf1、DSIF、Hif1、FACT等轉錄調控因子開展了研究工作,解析了Cdc73、SSRP1-M、Hif1、Hif1-H2A-H2B、Spt4-Spt5、CK2等一批蛋白質及蛋白質複合物晶體結構。通過測定這些轉錄因子及其複合物的三維結構,在原子水平上提供了這些轉錄因子及複合物與RNA 聚合酶II、核小體等相互作用的細節,進而為闡明這些...
①蛋白或DNA樣品純化 ②結晶 ③衍射、數據收集 ④確定蛋白結構 衍射數據→數據處理→相位解析→建模→模型修正→模型檢驗 ⑤理解結構與功能的相互關係 晶體生長 原理:蛋白質晶體內部結構為三維空間周期、有序、重複排列,要求每個結晶重複單位(分子或其複合體)的化學組成與分子構象是均一的。方法:為了獲得可供衍射的...
通過大規模BLAST搜尋,發現含有SBD結構域的蛋白在多達十四個門的一千多種細菌中廣泛存在,並驗證了這些含有SBD結構域的蛋白確實可以在體外實驗中結合磷硫醯化修飾DNA,在體內實驗中限制外來基因的轉移(Nature Communications,2018)。與曹春陽教授合作解析了細菌的DNA硫化修飾途徑中DndE蛋白的晶體結構(Cell Research, 2012...
這篇《線粒體呼吸鏈膜蛋白複合物II的晶體結構》論文,孫飛是第一作者,饒子和是通訊作者,如人們形容國際論文的一般慣例那樣,第一作者是“先鋒”,通訊作者是“主帥”,才26歲的博士生孫飛便是這樣的一位“先鋒”。“他們年紀雖輕,但都挑起科研的大梁了。”作為研究所所長,也作為課題組組長的饒子和滿心喜悅地說...
Prime: 精確的蛋白結構預測軟體包。Prime可以模建出高精度的受體模型,保證藥物研發後期的成功。Prime可精確模建Loop區。包含同源模建和threading兩種方法。Liaison:精確的配體-受體結合能計算程式,Liaison預測結合能在~1 kcal/mol的實驗值,可以套用到配體自由度比較大的情況。SiteMap: 精確的蛋白活性位點認證工具。
( 2 ) 芳香烴降解相關的調控蛋白NCgl1110以及其與芳香烴配體、核酸複合物的晶體結構和功能研究, 主持, 國家級, 2009-01--2011-12 ( 3 ) 重要病原微生物感染與耐藥性相關的膜蛋白結構功能研究, 主持, 國家級, 2013-01--2017-12 ( 4 ) 結核病耐藥相關的基礎和套用研究, 主持, 部委級, 2013-01--...
在研究工作中共測定了11個蛋白質及其複合物的晶體結構,在SCI收錄的國外期刊上發表論文17篇,參與編寫清華大學教科書1本。2009年12月回國工作,主要研究方向為靶向藥物篩選與設計,計算生物學和結構生物學,通過測定藥物靶點蛋白的結構,分析蛋白與小分子配體的結合機制,進而設計最佳化潛在的藥物分子,參與具有自主智慧財產權...
整體結構 上海光源設計為先進的第三代中能同步輻射光源,由一台全能量注入器包括:一台150MeV電子直線加速器、一台周長為180米的能在0.5秒內把電子束從100MeV加速到3.5GeV的全能量增強器和注入/引出系統、一台周長432米的3.5GeV的高性能電子儲存環、以及首批建成的7+1沿環外側分布的同步輻射光束線站和實驗...
1994年,他繼續讀博,考入中國協和醫科大學,誤打誤撞進入晶體學領域。1998年,施一公正在普林斯頓大學組建自己的實驗室,翻到了柴繼傑的簡歷,他覺得這個人很“邪乎”,居然在最基層的造紙廠工作了四年,還能再考上研究生。人物評價 “柴繼傑是研究蛋白質以及特定受體結構構成領域最傑出的學者之一。”(桂林理工大學...
2015年,領銜的團隊利用世界上最強X射線雷射,成功解析視紫紅質與阻遏蛋白複合物的晶體結構,攻克了細胞信號傳導領域的重大科學難題,該成果“攻克細胞信號傳導重大科學難題”入選兩院院士評選“2015年中國十大科技進展新聞”。人才培養 學術譜系 10多年間,徐華強在上海藥物所建立的上海藥物研究所藥靶中心、中科院受體結構與...
( 1 ) RNA病毒聚合酶的結構與功能研究, 主持, 部委級, 2013-01--2015-12 ( 2 ) 重要病毒轉錄複製複合體的結構功能研究, 主持, 國家級, 2013-01--2017-08 ( 3 ) 乙型腦炎病毒非結構蛋白NS5的晶體結構研究, 主持, 國家級, 2014-01--2017-12 ( 4 ) 豬瘟病毒NS5B蛋白N端結構域的功能研究, ...
研究室:藥物化學研究室、天然藥物化學研究室、藥理學第一、第二、第三研究室、中國科學院受體結構與功能重點實驗室 技術平台研究中心:藥物發現與設計中心、藥效評價研究中心、上海藥物代謝研究中心、藥物安全評價研究中心、藥物釋放系統研究中心、中藥現代化研究中心、藥物質量控制與固體化學研究中心、化學蛋白質組學研究...