蛋白質序列資料庫指套用計算機功能分析生物學信息的資料庫。套用計算機的運算法則,比較DNA和蛋白質序列而檢測結構、功能和序列之間的進化關係。各種基因組的序列產生大量的DNA序列數據和生物信息,已經被套用於研究基因的功能,預測以前未知的基因功能。現在人們的注意力主要集中在從僅有的胺基酸序列預測蛋白質結構和功能。
基本介紹
- 中文名:蛋白質序列資料庫
- 外文名:Atlas of Protein Sequence and Structure
蛋白質序列資料庫指套用計算機功能分析生物學信息的資料庫。套用計算機的運算法則,比較DNA和蛋白質序列而檢測結構、功能和序列之間的進化關係。各種基因組的序列產生大量的DNA序列數據和生物信息,已經被套用於研究基因的功能,預測以前未知的基因功能。現在人們的注意力主要集中在從僅有的胺基酸序列預測蛋白質結構和功能。
蛋白質序列資料庫指套用計算機功能分析生物學信息的資料庫。套用計算機的運算法則,比較DNA和蛋白質序列而檢測結構、功能和序列之間的進化關係。各種基因組的序列產生...
OWL是一個非冗餘的蛋白質序列資料庫,是由Leeds大學和Warrington的Daresbury實驗室合作開發的(Bleasby等,1994)。OWL資料庫由四個主要的一級序列資料庫複合而成,即...
蛋白質資料庫是指包括蛋白質信息的資料庫。常用的蛋白質資料庫有很多,其中Uniprot被認為收錄最廣泛和注釋信息最全面的蛋白質資料庫。Uniprot下包括Swiss-Prot、Tr...
PIR國際蛋白質序列資料庫是由蛋白質信息資源(PIR)、慕尼黑蛋白質序列信息中心(MIPS)和日本國際蛋白質序列資料庫(JIPID)共同維護的國際上最大的公共蛋白質序列資料庫...
序列資料庫是分子生物信息資料庫中最基本的資料庫,包括核酸和蛋白質兩類,以核苷酸鹼基順序或胺基酸殘基順序為基本內容,並附有注釋信息。...
生物大分子三維空間結構資料庫是一類重要的生物信息學資料庫。蛋白質結構資料庫(ProreinData Bank,PDB)是1971年創建的國際上最著名、最完整的蛋白質三維結構資料庫...
SWISS-PROT是含有詳細注釋內容的蛋白質序列資料庫,由歐洲生物信息學中心(EBI)維護,目前已合併入 UniProt資料庫,旨在幫助基因組和蛋白質組以及相關的分子生物學研究...
DNA序列資料庫是集合所有已知核酸的核苷酸序列,單核苷酸多態性、結構、性質以及相關描述,包括它們的科學命名、來源物種分類名稱、參考文獻等信息的資料庫。基因和基因組...
遺傳序列資料庫是為了更好地保存和處理生物序列數據,而將其存儲到大型計算機的資料庫中。根據資料庫中數據內容的不同,現有的生物序列資料庫包括基因序列資料庫、...
可通過Entrez資料庫查詢系統對GenBank進行查詢。這個系統將核酸、蛋白質序列和基因圖譜、蛋白質結構資料庫整合在一起。此外,通過該系統的文獻摘要資料庫MEDLINE,可獲取...
GenBank 是一個有來自於70,000多種生物的核苷酸序列的資料庫。每條紀錄都有編碼區(CDS)特徵的注釋,還包括胺基酸的翻譯。GenBank屬於一個序列資料庫的國際合作組織...
常用核酸序列資料庫綜合了DNA和RNA序列數據,其數據源於眾多的研究機構和核酸測序小組,以及科學文獻。資料庫中的每條記錄代表著一條單獨的、連續的、附有注釋的DNA或...
其它一些資料庫的數據涵蓋了DNA 序列,RNA序列,蛋白序列,蛋白質二級結構,蛋白質三級結構,基因突變體,生物代謝途徑等方面。門類齊全的網路資料庫正在為生物學的研究...
基因組資料庫(GDB)為人類基因組計畫(HGP)保存和處理基因組圖譜數據。GDB的目標是構建關於人類基因組的百科全書,除了構建基因組圖譜之外,還開發了描述序列水平的基因...
轉錄圖譜可以把基因組中能夠編碼蛋白質的部分集中起來,因此是一種重要的數據資源。中文名 UniGene資料庫 首要任務 對人類基因組進行全序列測 類型 據資源 訪問...
蛋白質共價修飾組學資料庫是" 十一五" 中國科學院信息化專項,由中國科學技術大學生命科學學院承擔,並與華中科技大學、大連化物所以及美國多倫多大學合作構建的專業...
歐洲分子生物學實驗室英國Hinxton分站EBI(European Bioinformatics Institute,歐洲生物信息學研究所),與世界上其他分子生物學資料庫進行合作研究,最主要的有EMBL核酸序列...
分子生物信息資料庫種類繁多。歸納起來,大體可以分為4個大類,即基因組資料庫、核酸和蛋白質一級結構序列資料庫、生物大分子(主要是蛋白質)三維空間結構資料庫、...
核酸資料庫,是指DNA、RNA序列的資料庫,主要包括已知序列名稱、DNA或RNA全序列及其特性,如啟動區、起始和終止密碼的位置、編碼區、限制酶切位點以及推導的翻譯產物...
孟德爾人類遺傳(OMIM),三維蛋白質結構的分子模型資料庫(MMDB),唯一人類基因序列集合(UniGene),人類基因組基因圖譜,分類學瀏覽器,同國立癌症研究所合作的癌症基因組...