常用核酸序列資料庫綜合了DNA和RNA序列數據，其數據源於眾多的研究機構和核酸測序小組，以及科學文獻。資料庫中的每條記錄代表著一條單獨的、連續的、附有注釋的DNA或RNA片段。國際上三大常用核酸序列資料庫為EMBL、GenBank和DDBJ。
基本介紹
- 中文名：常用核酸序列資料庫
- 三大資料庫：EMBL、GenBank和DDBJ
- 作用：蒐集、研究、更新、查詢
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簡介
三大核酸資料庫
DNA測序技術的迅速發展，使人類已知的DNA核酸序列不斷增長，常用核酸序列資料庫資料庫綜合了DNA和RNA序列數據，其數據源於眾多的研究機構和核酸測序小組，以及科學文獻。資料庫中的每條記錄代表著一條單獨的、連續的、附有注釋的DNA或RNA片段。在國際上逐漸建立了以GenBank、EMBL、DDBJ為代表的三大核酸序列資料庫。1988年，三大資料庫共同成立了國際核酸序列資料庫聯合中心，三方達成協定，對資料庫的數據更新同步。對於特定的查詢，三個資料庫的回響結果一致，僅在數據格式上有細微的差別。
功能
進行分子生物學研究，更新常用核酸序列信息，學術交流，同時面向全世界研究者提供資料庫當中的相關數據。
EMBL
歐洲分子生物學實驗室（EMBL）是一個分子生物學研究機構，由22個正式成員國，4個有前景的成員國家和2個準成員國共同成立。成立於1974年的EMBL是由來自其成員國的公共研究資金資助的政府間組織。 EMBL的研究由涵蓋分子生物學譜的約85個獨立組同時進行。
實驗室包含海德堡的主要實驗室和Hinxton的外部站（英國的歐洲生物信息學研究所（EBI）），格勒諾布爾（法國），漢堡（德國）和蒙特羅通多（羅馬附近）。 EMBL小組和實驗室在分子生物學和分子醫學方面進行基礎研究。 該組織幫助其成員國在新儀器以及生物技術方面的發展。其中，以色列是唯一擁有正式成員資格的亞洲國家。
GenBank
GenBank序列資料庫是所有可公開獲得的核苷酸序列及其蛋白質翻譯的開放資料庫。該資料庫由國家生物技術信息中心（NCBI）作為國際核苷酸序列資料庫協作（INSDC）的一部分運行和維護。國家生物技術信息中心是美國國家衛生研究院的一部分。 GenBank及其合作者接收來自超過100,000種不同生物體的世界各地實驗室產生的序列。自成立以來的30多年中，GenBank已成為幾乎所有生物領域研究最重要和最具影響力的資料庫，其數據被世界各地數以百萬計的研究人員訪問和引用。 GenBank繼續以指數速率增長，每18個月增加一倍。
DDBJ
日本的DNA資料庫（DDBJ）是收集DNA序列的核算序列資料庫，位於日本靜岡縣的國家遺傳學研究所（NIG）。它也是國際核苷酸序列資料庫組織INSDC的成員，每天與歐洲生物信息學研究所的歐洲分子生物學實驗室和國家生物技術信息中心的GenBank交換數據。因此，這三個資料庫在任何給定時間包含相同的數據。
DDBJ於1986年在NIG開始了資料庫活動，並且仍然是亞洲唯一的核苷酸序列資料庫。儘管DDBJ主要從日本研究人員那裡獲得數據，但它可以接受來自任何其他國家的貢獻者的數據。 DDBJ有一個國際諮詢委員會，由9名成員組成，每個成員來自歐洲，美國和日本3個成員。
