SWISS-PROT是含有詳細注釋內容的蛋白質序列資料庫，由歐洲生物信息學中心（EBI）維護，目前已合併入 UniProt資料庫，旨在幫助基因組和蛋白質組以及相關的分子生物學研究人員提供有關蛋白質胺基酸序列的最新信息。
基本介紹
- 中文名：Swiss-Prot蛋白質序列資料庫
- 外文名：Swiss-Prot Protein Sequence Database,
- 提出單位：歐洲分子生物學實驗室
- 性質：序列殘缺與疾病的關係
簡介,研究,
簡介
Swiss-Prot蛋白質序列資料庫，英文名稱：Swiss-Prot Protein Sequence Database，由歐洲分子生物學實驗室主持建立的蛋白質序列資料庫。
研究
SWISS-PROT中儘可能減少了冗餘序列，並與其它30多個數據建立了交叉引用，其中包括核酸序列庫、蛋白質序列庫和蛋白質結構庫等。SWISS-PROT資料庫包含了EMBL核酸序列資料庫中被經過仔細檢查和準確注釋了的蛋白質序列，一般地，任何蛋白質序列數據的搜尋和比較都應從SWISS-PROT開始。
SWISS-PROT蛋白質序列數據由大量序列條目組成，每一個序列條目有其自己的格式。為了標準化的目的，SWISS-PROT的格式與EMBL核酸序列資料庫的格式儘可能類似。SWISS-PROT涉及已知蛋白質的序列、引用文獻信息、分類學信息、注釋等，注釋中包括蛋白質的功能、轉錄後修飾、特殊位點和區域、二級結構、四級結構、與其它序列的相似性、序列殘缺與疾病的關係、序列變異體和衝突等信息。利用序列提取系統(SRS)可以方便地檢索SWISS-PROT和其它EBI的資料庫。SWISS-PROT只接受直接測序獲得的蛋白質序列，序列提交可以在其Web頁面上完成。
