若昂三世在位期間,在海外發現方面有兩件事情最為值得稱道。一是葡萄牙人於1557年開始在澳門定居;另一件事就是巴西的殖民化。在曼努埃爾時期,巴西的主要作用就是里斯本派往印度的船隊的中轉站。還有就是向國內提供巴西木和珍禽野獸。直到1530年正式的殖民活動才開始。就在這一年,第一批甘蔗被種植在了巴西的沼澤地上;第一台榨糖機也被組裝了起來。1534年,若昂三世將巴西沿海地區分割成許多塊世襲封地,賜給一些在國內沒有什麼土地的小貴族,以此鼓勵移民和墾荒活動。到1548年,巴西沿海已經建立起來了十六個葡萄牙人聚居的村鎮。除了巴西木以外,這個時候的特產又多了糖、棉花和菸葉。隨著巴西的經濟地位不斷上升,1548年設立了總督制,第一任巴西總督托邁·德·索薩(Tomé de Sousa)於1549年帶領著一千名移民和一批耶穌會教士來到了巴西。這批教士中有一個名叫曼努埃爾·德·諾布萊卡(Manuel de Nóbrega)的人在東南部的皮拉蒂寧卡村(aldeia de Piratininga)建立了聖保羅經院(Colégio de São Paulo),這就是後來的聖保羅市。但是當時巴西的中心不在東南而在東北。總督托邁·德·索薩將行政中心設在了東北部的沿海城市聖薩爾瓦多(São Salvador)。而經濟中心則在鄰近的伯南布哥(Pernambuco)地區。1584年有一位傳教士曾經對伯南布哥的社會狀況作了如下的描繪:“這裡的人們富有,許多人有四萬、五萬甚至八萬個克魯扎多(cruzado,葡萄牙古貨幣單位;當時一個有錢人家的傭人每年才掙四個克魯扎多)的家產;······ 這兒總共有十個到十二個糖廠老闆,他們輪流設宴,每天聚在一起大吃大喝,揮霍錢財······ 總之,伯南布哥遠比里斯本闊氣。”綠色為伯南布哥 紫色的中心聖薩爾瓦多
伊比利亞半島國家的航海活動是在文藝復興的背景下進行的,反過來航海活動的發現又為文藝復興運動注入了活力。建築上的表現就是“曼努埃爾式”裝潢的出現。文學上,記述航海活動的遊記性質的散文開始流行起來,其中最著名的當屬費爾南·門德斯·平托(Fernão Mendes Pinto)記述其遠東之行的《遊記》。因為這本書大大褒揚了中國和日本的文明和富饒程度,致使葡萄牙人都不願意相信;還拿作者的名字開玩笑:Fernão Mendes Pinto 變成了Fernão, Mentes?— Minto!(意即:費爾南,你撒謊吧?—對,我就是在撒謊!)。另外就是文藝復興時代最偉大的葡萄牙詩人路易斯·德·卡蒙斯(Luís de Camões,澳門譯做賈梅士)了。根據當時流傳在社會上的幾本東方遊記,再加上自己遠航到印度和澳門的經歷,他寫出了歌頌達·伽馬遠航印度事跡的長篇史詩《盧濟塔尼亞人之歌》(Os Lusíadas)。除了達·伽馬的事跡之外,他還借詩中人物之口,講述了從阿豐索·恩里克斯開國以來的葡萄牙歷史,字裡行間洋溢著無比的愛國熱情。據說這部史詩最精彩的篇章就是在印度和澳門寫就的。當代澳門東方葡萄牙協會旁邊的白鴿巢公園裡面,還留有當年他曾經避過雨的山洞,旁邊立有紀念碑。他逝世的日期六月十日(1580年)如今被定為葡萄牙及葡人社區日(Dia de Portugal e das Comunidades Portuguesas),供全世界的葡萄牙人紀念那段輝煌的過去。比卡蒙斯稍早的吉爾·文森特(Gil Vicente)被稱為“葡萄牙戲劇之父”,寫出了許多諷刺社會現狀的戲劇作品。義大利詩人彼得拉克發明的十四行詩(Soneto)也在這個時候傳入了葡萄牙,被卡蒙斯等人發揚光大,一直到十九世紀也仍然是葡萄牙文壇的主流。卡蒙斯手執《盧濟塔尼亞人之歌》