深水網箱海水魚類養殖所選擇的海域水質一定要合適，表層水溫8～28℃、溶解氧6毫克/升以上；pH7.8～8.6；透明度0.3米以上。網箱應設定在水流暢通、風浪較小的內灣，既要保證網箱中水體的交換量和溶解氧，又要保證網衣成固有的形狀。海區流速一般在50～100厘米/秒左右，以免魚頂流遊動消耗能量，影響魚類正常生長。
為了充分利用養殖海區和保持養殖海區的生態環境條件，防止養殖海區自污染而引起富營養化，造成魚病流行，網箱設定面積不宜超過養殖海區面積的10%。網箱布局應與流向相適應，可使水流暢通。為了便於操作管理，可以兩組並列排列，組與組間距80～100厘米，中間可設管理通道。列與列之間應在50米以上，網箱距海岸200米以上。
選擇能在當地水域正常生長，而且生長快、養殖周期短、經濟效益高的、放養大規格魚種經當年飼養後產品即可上市的養殖品種。放養密度的確定，應根據水域中天然餌料生物量，網箱設定水流交換狀況，魚類生物學特徵，網箱結構，飼養管理方式等綜合因素來確定。通常放養密度5～10千克/立方米，最終養殖密度20～40千克立方米。及時分箱很重要，如3厘米大小的鱸魚已能殘食小個體的同類，所以應將大小分開。待長到10厘米左右時分一次箱，長到20厘米左右時進行第二次分箱。
在養殖餌料的選擇、投餵方面，網箱養魚使用的餌料有鮮、凍小雜魚、小蝦、扇貝邊、貽貝肉及配合飼料等。新鮮飼料(冰鮮品、冷凍品)一般都能滿足魚類的營養需要，但變質腐敗、解凍不完全的飼料不宜投餵。餌料投餵量當年魚每天投餵體重的5%～30%，1齡魚每天投餵體重的1%～10%。最好在每100千克餌料中加入100克多種維生素和200克膽鹼，攪勻使用。投餵時要堅持定點、定時，根據魚的情況，每日投餵3次，最少不少於2次，上、下午各1次。為了不使餌料殘留、浪費，投餵時要慢投，不要讓餌料沉入箱底。
在養殖生產中隨著魚體生長要適時更換網目較大的網衣，以利於幼魚的生長，正常換網一般在30天左右。此外，網具上常會附著一些藻類、貝類及藤壺等附著生物，從而減少網箱的水體交換能力和增加網箱重量，因此必須定期用高壓水槍清除附著生物；或者在網箱中放養少量雜食性魚類，如鯔、籃子魚、羅非魚等，讓其攝食附在網衣上的藻類、貝類等。
