《核酸與小分子相互作用中的打分與對接研究》是裴劍鋒為項目負責人，北京大學為依託單位的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：核酸與小分子相互作用中的打分與對接研究
- 項目類別 ：青年科學基金項目
- 依託單位 ：北京大學
- 項目負責人：裴劍鋒
科研成果,項目摘要,
科研成果
序號 | 標題 | 類型 | 作者 |
|---|---|---|---|
1 | 第十三屆中國藥學會-施維雅青年藥物化學獎 | 科研獎勵 | 裴劍鋒| |
2 | A fast protein-ligand docking algorithm based on hydrogen bond matching and surface shape complementarity | 期刊論文 | Zhu, Yushan|Pei, Jianfeng|Luo, Wenjia| |
3 | Discovering Potent Small Molecule Inhibitors of Cyclophilin A Using de Novo Drug Design Approach | 期刊論文 | Ni, Shuaishuai|Jiang, Hualiang|Lai, Luhua|Mao, Xiaona|Lv, Maosheng|Li, Jian|Shen, Xu|Huang, Jin|Zhu, Jin|Yuan, Yaxia|Pei, Jianfeng| |
項目摘要
核酸是重要的藥物作用靶標。目前以核酸為靶標的藥物分子設計技術進展較慢，不能滿足日益增長的基於核酸靶標的藥物研究需求。打分和對接是藥物設計中最基本和常見的問題，本課題擬發展一種通用精確計算核酸-小分子相互作用自由能的方法（打分），以及發展一種核酸-小分子快速精確對接的方法（分子對接），以此開展以核酸為靶標的藥物設計方法的研究、探討核酸與小分子相互作用機理。為了解決可用實驗數據少的難點和提高精度，將利用目前較先進的DFIRE算法[1,2]和我們最新發展的自由旋轉（free-rotating）和自避（self-avoiding）鏈模型[3]等思路來發展基於統計平均勢的通用打分函式。分子對接算法擬基於我們最新的PSI-DOCK算法[4]發展，並進一步提高精度和速度。新對接算法還將同時計算受體分子和配體分子在結合過程中的柔性運動。
