《蛋白質與核酸對接的計算模型研究》是依託華南農業大學，由常珊擔任項目負責人的專項基金項目。
基本介紹
- 中文名：蛋白質與核酸對接的計算模型研究
- 項目類別：專項基金項目
- 項目負責人：常珊
- 依託單位：華南農業大學
- 負責人職稱：教授
- 批准號：11047183
- 申請代碼：A25
- 研究期限：2011-01-01 至 2011-12-31
- 支持經費：4（萬元）
項目摘要
蛋白質-核酸間相互作用與識別對細胞中的分子生物學機理研究，計算機輔助藥物設計和複合物結構預測都具有重要的意義。蛋白質與核酸的相互作用非常複雜，因此分子模擬需要考慮其特點有針對性的構建模型。本項目旨在通過蛋白質-核酸對接方法的研究探索蛋白質-核酸間相互作用與識別的機制。我們將針對分子對接方法的兩個難點：打分函式和分子柔性展開研究。通過複合物結構分析，構造新的胺基酸-鹼基成對勢函式，結合課題組前期發展的多種打分方法，設計適合於蛋白質-核酸對接不同階段評價的打分函式。構象搜尋將綜合考慮分子柔性和計算效率，發展多階段的蛋白質-核酸分子對接方法，並結合短時間的分子動力學模擬進一步考慮蛋白質和核酸分子的柔性。該項目將為揭示蛋白質-核酸相互作用機理提供有益探索。
