揚州國家高新技術產業開發區前身是邗江經濟開發區,2015年9月29日經國務院批准為國家高新技術產業開發區。
2001年揚州高新區開始建設,2006年被省政府批准為省級經濟開發區,2012年成立了江蘇省揚州高新技術產業開發區產業發展規劃評審委員會,對江蘇省揚州高新技術產業發展規划進行了評審並原則通過, 2012年11月,江蘇省人民政府‘蘇政復(2012)100號’做出了關於江蘇揚州邗江經濟開發區更名為江蘇省揚州高新技術產業開發區的批覆。 2015年9月晉升國家高新技術產業開發區。
2016年4月16日,揚州國家高新技術產業開發區舉行建設推進大會。科技部副部長陰和俊、副省長張敬華出席會議並共同為揚州國家高新區揭牌並致辭。會議由揚州市委書記謝正義致辭,市長朱民陽主持會議。
揚州國家高新區總規劃面積60平方公里,北至江陽西路、南至沿江高等級公路、西至烏塔溝、東至古運河,初步形成了北園、南園、西園和汊河片區四個板塊,已經建成14.8平方公里。