基本介紹
- 中文名:序列比對
- 外文名:sequence alignment
- 理論基礎:進化學說
- 用途:語言進化的研究
- 重要性:對算法的研究具有非常重要的意義
為確定兩個或多個序列之間的相似性以至於同源性,而將它們按照一定的規律排列。將兩個或多個序列排列在一起,標明其相似之處。序列中可以插入間隔(通常用短橫線“-...
把兩個以上字元序列對齊,逐列比較其字元的異同,使得每一列的字元儘可能一致,以發現其共同的結構特徵的方法稱為多序列比對。多序列比對問題是雙序列比對問題的推廣...
多重序列比對(Multiple sequence alignment;MSA)是對三個以上的生物學序列(biological sequence),如蛋白質序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比對。一般來說,是輸入一...
《進化算法在生物多序列比對中的套用》是2017年清華大學出版社出版的圖書,作者龍海俠、李滿枝、王洪濤、付海艷。...
基本概念 也稱比對結果,通常是指2件或2件以上的事件或信息、試驗等結果進行比較,對比說明。也有在實驗室的同步比對實驗生物中出現比對結果。比如DNAMAN序列比對結果...
《生物計算:生物序列的分析方法與套用》介紹生物計算中的幾種主要方法,如序列比對、系統發育分析、蛋白質序列的語義分析與結構預測、基因識別與生物晶片的數據分析等,...
序列比對結果顯示, 從疣粒野生稻中得到的序列與網上預測的栽培稻序列的差異較大。同源序列克隆法同源基因克隆存在的問題與展望 編輯 ...
《生物序列突變與比對的結構分析》共分三部分介紹,第一部分介紹序列圖便於比對的結構模型;第二部分介紹序列的比對算法與結構分析;第三部分是有關隨機分析與圖論的...
某一給定元素暈最高水平與最低水平某種參數的比值。將對比係數按遞減次序排列,可以表明元素的分帶序列。...
MultAlin方法也是基於用一系列雙重比對開始的思想,然後基於雙重比對的打分值進行一個分層次的聚類。當序列都分成類後,開始進行多序列比對,計算出多序列比對中的兩個...
序列比對中,不同序列的同一個位點都是同源的。在接受分析的一個序列組中,序列之間的系統發育史是相同的(比如,序列組中不存在核序列與細胞器序列的混合)。...
全基因組重測序是對已知基因組序列的物種進行不同個體的基因組測序,並在此基礎上對個體或群體進行差異性分析。SBC將不同梯度插入片段(Insert-Size)的測序文庫結合...
庫中存在的每條已知序列都將同所查序列作一對一地核酸序列比對。4、TBLASTN是蛋白序列到核酸庫中的一種查詢。與BLASTX相反,它是將庫中的核酸序列翻譯成蛋白序列,...
16SrDNA鑑定是指用利用細菌16SrDNA序列測序的方法對細菌進行種屬鑑定。包括細菌基因組DNA提取、16SrDNA特異引物PCR擴增、擴增產物純化、DNA測序、序列比對等步驟。是一...
ITS(Internal Transcribed Spacer)鑑定是指對ITS序列進行DNA測序,通過將測序得到的ITS序列與已知真菌ITS序列比較,從而獲得待測真菌種屬信息的一種方法。英文:Internal ...
兩個序列比對常採用動態規划算法,這種算法在序列長度較小時適用,然而對於海量基因序列(如人的DNA序列高達10^9bp),這一方法就不太適用,甚至採用算法複雜性為線性的...
3.3.4局部比對搜尋工具 (BLAST)3.4雙序列比對的顯著性:一致性百分比3.4.1雙序列比對統計顯著性檢驗3.4.2全局比對的統計顯著性...