審計軌跡是指從報表檢査到帳簿、分錄直至原始憑證和檔案的追溯過程。在電子數據處理下,審計軌跡包括兩層含義:其一是軟體程度的軌跡。如材料儲備的處理過程中,當達到需要購買材料的“訂購點”時,電腦內藏的程式就會自動觸發,“訂購單”自動印出。這類程式平時深藏不露,只有設計程式的人員才知道。其二是經濟業務的實質性記錄。
由於原始憑證的內容和數據都需要先轉換為打孔卡片紙帶,然後錄入電子磁碟或磁帶,其中間的處理過程是藉助電腦自動完成,也就是最主要的會計工作和證據都在“黑盒子”(BlackBox)(中央處理系統和輔助系統)中進行。這些實質性記錄沒有明顯的證據,即所謂“無紙性”證據。這些“審計軌跡”的中斷,使審計人員必須改變傳統的審計技術。