內蒙古自治區交通運輸管理局是內蒙古自治區交通運輸廳直屬單位。
1、宣傳貫徹執行國家和自治區有關交通運輸的方針、政策、法規。
2、負責組織、實施縣以上公路（水路）客貨運輸站、場等基礎設施、車輛貸（借）款計畫，報批 後組織實施。
3、編報公路（水路）運輸年度基礎設施建設、車輛貸（借）款計畫，報批後組織實施。
4、負責涉外運輸管理工作的實施、監督、檢查、和口岸汽車運輸管理站的管理。
5、負責省際間和盟市間運輸業務的協調、管理與服務。審核跨省區、跨盟市公路客運和零擔運輸 線路。
6、組織、指導公路運輸行業駕駛、修理和檢測人員的培訓、技術等級考核工作。
7、負責運輸管理費和公路客運附加費的徵收管理工作，並實施監督、檢查。
8、負責公路（水路）運輸管理人員培訓、考核、工作、著裝及道路運輸檢查證發放管理。
9、按章負責公路（水路）運輸票證、單據的印製、發放和管理。
10、負責組織交通運輸的經濟信息、情況交流、技術諮詢。
11、參與公路 ( 水路 ) 運輸行業三資企業的資格審查和立項申報工作。
12、負責對駕校和駕駛員培訓工作實施巨觀方面的行業管理，包括制定管理制度。
13、參與公路（水路）運輸行業的行風建設，保護合法經營，規範經營行為，維護市場秩序。
14、負責交通廳交辦的其他事宜。
