工作機構：
辦公室、藥品工業科、市場監管科、藥材生產科。
科室職能
(1)辦公室
①負責局長辦公會議、行政會議和黨組（黨組織）會議記錄工作；
②根據要求負責起草各種文字材料；
④承辦文秘、檔案、機要、提案工作，接收、傳達、反饋工作信息；
⑤負責機關資產、經費和行政管理工作
⑥協調做好市委管理的領導班子、領導幹部的有關工作；
⑦負責局機關及直屬單位人事獎懲、考核考評、機構設定、人員編制、勞動工資、聘用、管理工作；
⑧按乾管範圍辦理幹部、職工退離休手續並負責做好退離職人員、遺屬工作；
⑨配合有關科室聯繫和指導藥界各類民間組織活動工作；
⑩做好藥業發展基金的籌集、管理工作。
（2）藥品工業科
①組織建立全市藥業經濟信息網路，做好使用、管理有關信息工作，預測監測藥業經濟巨觀運行情況，負責微機室管理、資料庫的建立和使用工作；
②經濟信息的蒐集、整理、調查研究、反饋和發布；
③配合有關部門負責藥業經濟的對內對外聯繫，並提出決策建議；
④編制全市藥業發展規劃，並組織實施和監督檢查；
⑤協調和引導藥業經濟的結構、產品、經營機制調整，不斷提高科技化、高品質化、規範化、規模化、集團化種植、經營水平，逐步與國際接軌，創造和形成外向型藥業經濟；
⑥按照WTO的規則，配合有關部門研究策劃中藥材交易中心的升級改造，使其不斷發展壯大；
⑦負責指導西藥、藥械、有毒藥品經營企業的規範化有序經營；
⑧配合有關部門參與承辦每年一度的全國中醫藥交易會。
⑨承辦局領導交辦的其它工作。
（3）市場監管科
①負責藥業政策、法規的宣傳工作；
②負責管理、協調和指導藥業生產及流通工作；
③負責行業法制宣傳教育和理論研究工作；
④宣傳教育藥農、藥商和生產流通實體依法經營，配合有關部門清理整頓生產、經營秩序；
⑤配合有關部門依法打擊生產經營中的不法行為；
⑥按有關規定受理有關申請、登記、換證等報審工作
⑦協調有關部門對行業的檢查驗收工作；
⑧配合有關部門監管中藥材交易中心的經營工作；
⑨參與辦理一年一度的全國中醫藥交易會。
⑩承辦局領導交辦的其它工作。
（4）藥材生產科
①根據國家產業政策和省市要求，編制全市中藥材生產規劃；制定中藥材生產有關舉措的實施方案並負責監督落實；
②組織協調全市中藥材的標準化、規範化規模化、基地化大生產；組織指導對中藥材的種質、種源、品質進行研究，不斷提高種子種苗的質量；
③搞好中藥材GAP宣傳、教育、培訓工作；配合有關部門做好中藥材GAP及其基地建設的申報、檢查、驗收、評審、認證等工作；
④做好中藥材生產企業的對內對外聯繫、招商引資和項目論證指導服務工作；
⑤作好全市中藥材生產的調查研究、信息收集和數字統計；
⑥預測和監測中藥材生產巨觀運行情況，向政府和藥農提供有價值的供求信息；
⑦承辦局領導交辦的其它工作
