最近十餘年,在國家自然科學基金、“211”及“985”專項基金等的資助下,套用化學系近五年承擔各類科研項目300多項,其中包括國家自然科學基金項目50餘項、國家重點基礎研究計畫(“973”)、“863”高新技術項目、國家“九五”、“十五”科技攻關項目、“十一五”、“十二五”國家支撐計畫、國家公益性行業專項、教育部基本科研業務費及各類縱向項目,年平均基金4500萬元。科研成果豐碩,歷年來申請發明專利70餘項,授權30餘項;成果鑑定10餘項,獲得農藥臨時登記證的自主智慧財產權品種3個;完成新型施藥機械產品2個;獲教育部科技進步一等獎1項、其它省部級二等獎2項。經有關專家鑑定認為,小麥化學雜交劑BAU-9403、植物生長調節劑CAU-9901、農藥分析監測體系、系列微乳劑及微膠囊劑、高效施藥機具、手性農藥環境行為等研究結果達到國際先進水平;科學研究成果不斷在Chemical Reviews, Journal of the American Chemical Society, Angewandte Chemie International Edition、Environment Science & Technology、Journal of Chromatography A、Journal of Agricultural and Food Chemistry、Food Chemistry等國際著名期刊發表,發表論文數目及影響因子位居全校前列。