據2017年1月研究院官網顯示,研究院擁有Annual Reviews現刊、ACS Journals、AIP Journals、ACM Digital Library、American Society of Plant Biologists、American Society of Neuroradiology、American Society of Health-System Pharmacists、APS Journals、ASA-CSSA-SSSA、American Society of Agricultural and Biological Engineers、American College of Chest Physicians、American Association on Intellectual and Developmental Disabilities、Allen Press、American Institute of Biological Sciences、American College of Physicians、American Society of Nutrition、節能與環保開放社會經濟信息集成與服務系統、新材料行業開放社會經濟信息集成與服務系統、能源行業開放社會經濟信息集成與服務系統、Wiley-Blacwell現刊資料庫(非集團刊)、SpringerLink期刊-CLOS、SpringerLink電子圖書(含叢書)、中科院機構知識庫、Wiley電子圖書、RSC電子圖書、SpringerLink期刊-RLOS、中科院古籍資料庫、Elsevier回溯、CNKI科技類博碩士學位論文資料庫、Cambridge Journals回溯、IOP電子圖書、全院統一自動化資料庫、Springer Protocols(1980-2012)、中國科學院學位論文服務系統、Digital Library of MIT Theses、聯合西文期刊篇名目次庫、中國數學文獻資料庫、全國期刊聯合目錄資料庫、NSCEP、CSA-COS Pivot、Nature(1869-1986)、Turpion回溯資料庫、IOP(1874-2002)、Project HOPE Journal、University of Toronto Press、SpringerLink回溯資料庫、Royal Society of Medicine、Computing Reviews、Rapra Technology Limited、Royal Society、Multi-Science Publishing Co Ltd、Mary Ann Liebert, Inc、Maney Publishing、Radiological Society of North America、IOS Press Journals、中國資訊行搜數網、Cold Spring Harbor Laboratory Press、CSA-PapersInvited、CSA-CSA Illustrata: Technology、Future Science、White Horse Press、CSA-CSA Illustrata: Natural Sciences、CSIRO Journals、University of Chicago Press、NRC Research Press、GeoScienceWorld、Frontiers in China系列期刊、Botanical Society of America、Berkeley Electronic Press、IGI Global、Ecological Society of America、Canadian Institute of Forestry、Beech Tree Publishing、NetLibrary電子圖書、Faculty of 1000、Ei Engineering Village 2、ScienceChina、ISI Highlycited.com、ISI Essential Science Indicators、ISI Current Contents Connect、ISI BP、SpringerLink-Landolt-Bornstein、ISI Century of Science、ISI Derwent Innovations Index、ISI Proceedings、ISI Medline、ISI Web Of Science-Science Citation Index Expanded、ISI INSPEC、SPIE Digital Library、Oxford University Press、Nature(1987-1996)、JSTOR、ProQuest Dissertations & Theses B、方正中文電子圖書、SpringerLink期刊、RSC、ProQuest Dissertations & Theses 全文資料庫、Nature+NSJ、Science Online、PNAS美國科學院院報、IEEE/IEE Electronic library、CNKI科技類期刊資料庫、Wiley-Blacwell現刊資料庫(集團刊)、IOP Electronic Journals、Elsevier ScienceDirect、Cell Press、Cambridge Journals現刊等資料庫資源。