目前大多數商業化的核酸染料(凝膠染色試劑)總是在安全性、穩定性和靈敏性等方面不完全令人滿意。例如,雖然 EB (溴化乙啶)作為目前使用最廣泛的核酸凝膠染色試劑,能夠在多數套用中提供可以接受的靈敏度,但它是一種高誘變性的化學物質。而且EB染色後具有較高的背景螢光信號(如圖1)。 SYBR Green I 和 SYBR Gold 也被廠家宣傳為最靈敏的凝膠染色試劑。但 SYBR Green I 尤其是 SYBR Gold 在常用的微鹼性電泳緩衝溶液或預製凝膠中會快速降解,穩定性差導致染色效果極不可靠。 SYBR safe 被認為是市場上較為安全的核酸染料 ,但它的染色效果還遠不及 SYBR Green I 。圖1
至於國內有公司宣稱的新產品Goldview,我們不想多加評論。因為從極為相似的對比試驗結果來看,該產品似乎就是AO(丫啶橙 ,一種劇毒產品,且螢光亮度不佳)。請看Goldview 與 AO 對比試驗結果(其中Goldview是從國內某公司採購,AO則來自SIGMA,報告來自開放生物)
B) 30 min incubation圖 3. 在37°C下,分別使用1X SYBR Green I, SYBR Safe, GelRed and GelGreen 對HeLa 細胞進行孵化,並分別在5分鐘(A)和30分鐘(B)後觀察。實驗顯示SYBR染料迅速進入細胞並將細胞內的核酸染成亮綠色(以上僅圖示 SYBR Green 1),而 GelRed 和 GelGreen 則因為不能穿透細胞膜而完全沒有進入細胞內, 足以證明GelRed和GelGreen是安全的。