遊戲方式如同過去的反恐精英系列,藉由一隊扮演反恐部隊、一隊扮演恐怖分子,在每一輪交戰中彼此試圖完成地圖上的指定目標(如拆除/引爆炸彈或拯救/囚禁人質等),或者通過擊斃對手所有成員的方式以取得勝利。《反恐精英:起源》中不論是遊戲畫面或者是遊戲人數、地圖精緻度、武器界面、電腦AI等,皆與早先《反恐精英》系列有許多不同處,如通過Source引擎使地上的鐵桶、垃圾等都可與角色有互動關係。而在一些世界級比賽中的反恐精英項目上,《反恐精英:起源》也逐漸取代過去《反恐精英 Version 1.5》、《反恐精英 Version 1.6》的地位,但亦有人較為喜愛之前的版本。
《反恐精英:起源》能夠以Source SDK來添加新的皮膚和模型,且進而於比賽中使用。皮膚是指將實際外表圖像放於武器、地圖、人物模組等,模型則是以三維繪製來重新製造一個全新的模組。為確保只有特定的模型和皮膚可使用,可藉由伺服器的wallhacks來選擇控制。常見的模型及皮膚修改的的例子,包括武器外觀的修改(如把M4A1改成FN SCAR突擊步槍、伯奈利M4 Super 90霰彈槍改成弗蘭基SPAS-12霰彈槍等)、人物外觀的修改等。
《反恐精英:起源》中將槍枝的準星再次重新調整,當玩家不斷按住滑鼠按鈕使槍枝不斷射擊時,準心將會不斷增大以表示受到后座力影響。而相對於《反恐精英 Version 1.6》,《反恐精英:起源》中射擊目標距離愈遠,隨機性也就愈高,但相對來說后座力倒是有些微下降。而除了槍枝外觀的精緻度大為提升外,幾乎所有的槍枝都賦予了新的射擊聲音,而這之中有一部份是自《反恐精英:零點行動》轉擋過來,而一些是從過去檔案中分化出來。而在多人在線上遊戲中,儘管仍可以像過去聽見敵人裝彈的聲音,但卻取消能聽到換槍聲的設計。
在《反恐精英 Version 1.6》中,閃光彈僅僅只把玩家的螢幕全部歸成白色,之後依角度、方向等因素來決定失明時間的多寡與否。而在《反恐精英:起源》中,一開始也是同過去螢幕全白,使玩家無法辨識方向;但除此之外,玩家也僅會聽到一高音頻的尖嘯聲,而其它的聲音則完全無法識別,包括腳步聲、隊友呼叫聲以及槍聲。當閃光彈爆炸5秒以後,玩家雖然可以漸漸看到東西,但是看到的只是被閃光彈爆炸前最後一眼的模糊殘像,而不是現有景象。
在《反恐精英 Version 1.6》中,手榴彈爆炸後的火焰和碎片會不合理的“擴散”至玻璃、木箱和牆壁一側。而在《反恐精英:起源》中,爆炸的威力並不能跨過大部分的牆壁。除此之外,如果手榴彈爆炸於玩家附近時,除了會耗損血量外亦會影響到玩家角色的聽覺,螢幕也會震動並變得模糊不清。而手雷爆炸後,亦會明顯的影響附近可移動物品,如屍體、瓶子、箱子、槍枝等皆會像現實生活般震飛。
在《反恐精英 Version 1.6》中,煙霧彈所散發的為白色煙霧。而在《反恐精英:起源》中則改為暗黑色的,而在傳播速度上也大大逼真於過去的效果(但在反恐精英最近的重大更新中,兩者的煙霧效果越來越逼近)。而當玩家角色佇立在煙霧中時,螢幕也將見到許多足以堵擋眼前視線灰色煙霧。而當玩家在煙霧外部時,亦有可能見到煙霧內部激發的火光。