DNA拓撲學是一個專業術語。
基本介紹
- 中文名：DNA拓撲學
- 外文名：DNA拓撲學
- 比連環差：σ = L - T / T
- 連環數：右手螺旋正、左手螺旋負
名稱來源,DNA拓撲學參數,
名稱來源
首先以一260 bp雙鏈線形B-DNA為例，此DNA在鬆弛時，螺旋數為25（260/10.4），首尾連線成環形後，為一鬆弛環形DNA，並處於最穩定狀態。若將此線形DNA先擰松2個連環再連成環形，則可以形成兩種環形DNA，一種稱為鬆弛解鏈環形DNA；另一種環形DNA稱為超螺旋DNA，其螺旋周數為25，有2個負超螺旋。由此引入拓撲學參數。
DNA拓撲學參數
1.連環數（Linking number）：在雙螺旋DNA中，一條鏈以右手螺旋繞另一條鏈纏繞的次數，以L 表示（或以α表示），其計數方法為處於鬆弛環形DNA時的螺旋周數，肯定為整數，右手螺旋為正、左手螺旋為負。
2.纏繞數（Twisting number）：即DNA分子中的Watson-Crick螺旋周數，以T 表示(或以β表示)，其數值可直接在處於最穩定狀態下的雙鏈環形（或超螺旋形式）DNA中的實際螺旋周數計數得到，不一定是整數，右手螺旋為正，左手螺旋為負。但必須注意T僅針對於形成雙螺旋區域而言，解鏈部分的bp數就不涉及T的計算。對於一定長度的DNA雙鏈，一旦出現解鏈T值就減少。如260bp B-DNA雙鏈自然狀態下T=25，解鏈20%時的T=20 。
3.超螺旋數 或 紐數（Writhing number）：其數值有公式L=T+W 計算得到，以W表示（或以τ表示），不一定為整數。左手超螺旋為正，右手超螺旋為負（此點解釋見後）。
4.比連環差：為雙鏈DNA的超螺旋密度。用σ表示，由公式σ =( L - L0 )/L0 得到。
拓撲異構酶Ⅱ
拓撲異構酶Ⅱ