環狀DNA拓撲學

確定雙鏈環狀DNA的一種拓撲狀態需要從三個層次上來描述。在第一和第二水平上我們需要把DNA認為和DNA軸一致的簡單曲線。第一水平用一個對應於未結邊的環或一種特別的結型的孤立的閉合曲線來描述拓撲。如果我們有許多DNA分子，一些可以和其他形成拓撲連線，第二水平的拓撲就是確定連線的。第三水平的描述確定由互補鏈形成的連線。