DNA合成控制器

DNA合成控制器是指導和初始合成儀的所有活動的部件，它的主要部分是軟體、微處理機、顯示螢幕、鍵板及相關的電子部件。軟體控制合成的所有必要操作並由微處理機來解釋和執行。軟體儲存在一個可取出的存儲卡中，這個存儲卡插在儀器的背面。

合成信息顯示在液晶顯示屏上，通過選擇鍵板上的鍵可與儀器交流。軟體是"選單驅動"，通過按適當的鍵，可選擇一項，給予指令。為了完成自動合成，軟體套用一個包含一系列步驟的循環來完成全部化學反應。