面向蛋白相互作用關係的網路建模和分析

《面向蛋白相互作用關係的網路建模和分析》是依託復旦大學,由王飛擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:面向蛋白相互作用關係的網路建模和分析
  • 依託單位:復旦大學
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:王飛
  • 研究期限:2007-01-01 至 2009-12-31
  • 批准號:60673016
  • 支持經費:24(萬元)
  • 申請代碼:F0214
  • 負責人職稱:副教授
項目摘要
本項目將基於國內外公開提供的生物資料庫,提出新的計算機方法和理論以便在蛋白質組層次構建蛋白-蛋白相互作用網路。重點研究(1)多個資料庫的集成方法,提出從含有噪音比例各異的不完備數據中進行加權集成的方法和反饋更新權重的方法;(2)蛋白相互作用和諸多相關特徵之間的關係,套用集成學習方法和半監督學習思想研究特徵之間的獨立/依賴關係,依據和蛋白相互作用相關的強弱程度提出對特徵進行加權的集成預測方法;(3)域相互作用的識別和套用,整合性套用多種機器學習方法,突破多事例學習要求事例之間相互獨立的限制,和解決包中的部分事例有標籤這個難題;(4)網路基序識別算法,以高效地發現網路基序,並套用於新的蛋白功能確定和相互作用網路的構建;(5)在上述研究基礎上,研製自主的軟體分析平台並進行實際套用。.本項目研究將首先套用於酵母相關數據以驗證所提出的理論和方法的有效性,並進一步套用於其它細胞和組織。

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