為貫徹落實中共中央、國務院《法治政府建設實施綱要（2015—2020年）》，全面加強食品藥品監管系統法治建設，積極推進食品藥品監管部門依法行政，2016年8月8日，食品藥品監管總局印發了《關於全面加強食品藥品監管系統法治建設的實施意見》。
為貫徹落實中共中央、國務院《法治政府建設實施綱要（2015—2020年）》，全面加強食品藥品監管系統法治建設，積極推進食品藥品監管部門依法行政，2016年8月8日，食品藥品監管總局印發了《關於全面加強食品藥品監管系統法治建設的實施意見》（以下簡稱《意見》）。
《意見》提出，要認真貫徹落實《中共中央關於全面推進依法治國若干重大問題的決定》和《法治政府建設實施綱要（2015—2020年）》要求，落實創新、協調、綠色、開放、共享的發展理念，圍繞保障公眾飲食用藥安全，堅持科學立法、深入普法、自覺守法、嚴格執法，全面加強食品藥品監管系統法治建設，進一步提高食品藥品監管法治化水平。到2020年，食品藥品監管系統法治建設的總體目標是：科學完備的食品藥品安全法律制度體系基本建成，高素質的專業化監管隊伍基本建立，法治精神、法治理念與法治思維得到深入普及，職能清晰、執法嚴明、公開公正、廉潔高效的食品藥品監管部門基本建成。為實現上述目標，《意見》提出了八個方面的重點工作安排：
一是要加快食品藥品監管法律體系建設。《意見》提出，要完善食品藥品監管立法工作機制，加快食品藥品監管法律法規規章的立法進度，加快完善懲治食品藥品犯罪的司法解釋，積極推動地方食品藥品監管立法，加強食品藥品監管規範性檔案合法性審查，加快食品藥品監管規範性檔案清理，提高食品藥品監管立法公眾參與度。
二是要落實簡政放權放管結合最佳化服務改革要求。《意見》提出，要深入推進食品藥品行政審批制度改革，推行食品藥品監管權力清單、責任清單並實施動態管理。
三是要推進食品藥品監管行政決策科學化、民主化、法治化。《意見》提出，要健全食品藥品安全監管依法決策機制，完善食品藥品監管法律顧問制度。
四是要堅持嚴格、規範、公正、文明執法。《意見》提出，要完善食品藥品監管執法程式，加強系統食品藥品監管執法指導。
五是要深入開展食品藥品法治宣傳教育。《意見》提出，要科學制定食品藥品監管“七五”普法規劃，廣泛宣傳食品藥品監管法律法規。
六是要強化對食品藥品監管權力的制約和監督。《意見》提出，要全面推進食品藥品監管政務公開，健全食品藥品監督制約機制。
七是要依法有效化解食品藥品監管社會矛盾糾紛。《意見》提出，要充分發揮社會監督和輿論監督作用，加強食品藥品安全行政複議與應訴工作。
八是要全面提高食品藥品監管執法人員法治思維和依法行政能力。《意見》提出，要樹立重視法治素養和法治能力的用人導向，加強對食品藥品監管執法人員的法治教育培訓，完善食品藥品監管執法人員法治能力考查測試製度，普遍開展食品藥品監管公職律師工作。
為進一步抓好落實，《意見》明確要把黨的領導貫徹到食品藥品法治建設各方面。《意見》從加強對食品藥品監管法治工作的組織領導、強化法治建設考核評價和督促檢查、強化基層食品藥品執法隊伍建設、落實食品藥品監管執法經費保障、加強食品藥品監管法制機構建設五個方面提出了組織保障和落實機制方面的要求。
