開放閱讀框

在分子生物學中，開放閱讀框(Open Reading Frame, ORF)從起始密碼子開始，是RNA序列中具有編碼蛋白質潛能的序列，結束於終止密碼子連續的鹼基序列。

由於密碼子（codon）讀寫起始位點的不同，DNA序列可能按六種ORF閱讀和翻譯（每條鏈三種，對應三種不同的起始位點）。ORF識別則是確定哪種開放閱讀框對應真正的多肽編碼序列的過程。

在真核生物中，ORF可能跨過外顯子，在mRNA中進行拼接。

基本介紹

• 中文名：開放閱讀框
• 外文名：Open Reading Frame（ORF）
• 別名：開放式閱讀框架、開放讀架等
• 定義：結構基因的正常核苷酸序列

詞語釋義

開放閱讀框[open reading frame，ORF] 是結構基因的正常核苷酸序列，從起始密碼子到終止密碼子的閱讀框可編碼完整的多肽鏈，其間不存在使翻譯中斷的終止密碼子。

在mRNA序列中，每三個連續鹼基(即三聯“ 密碼子”） 編碼相應的胺基酸。其中有一個起始密碼子AUG和三個終止密碼子UAA，UAG，UGA。核糖體從起始密碼子開始翻譯，沿著mRNA序列合成多肽鏈並不斷延伸，遇到終止密碼子時，多肽鏈的延伸反應終止。由於讀寫位置不同，ORF在兩條鏈上具有六種可能性。

一條鏈中的3種ORF

軟體介紹

現在有很多找ORF的軟體，包括線上的，如：ORF Finder的功能ORF Finder被用來預測已存在的編碼區的小基因序列。它較早應於序列設計，套用優於長片斷、高質量的匹配。ORF Finder把提交序列分成六個亞區，並對這六個閱讀框分別進行默認，賦予每個亞區一個確定其編碼內容的度量， 如果可能將對每一亞區進行進一步分析。每個亞區按照已有的分類結果，被隨機提交給查找它們是否編碼 蛋白質的特定測試收集器。最後只有那些具有編碼潛能的重要區域才被報導。