《長鏈非編碼RNA-MEG3調控EMT影響胃癌侵襲遷移分子機制研究》是依託鄭州大學，由陳小兵擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：長鏈非編碼RNA-MEG3調控EMT影響胃癌侵襲遷移分子機制研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：陳小兵
- 依託單位：鄭州大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
胃癌是中國第二大常見惡性腫瘤，上皮間質轉化(EMT)是胃癌侵襲轉移研究的熱點。研究表明，miRNA和長鏈非編碼RNA(lncRNA)參與調控腫瘤EMT過程，但有關lncRNA調控胃癌EMT的研究甚少。在前一自然基金資助下，我們發現lncRNA-MEG3在胃癌組織中表達下調，進一步研究表明MEG3在TGF-β誘導後表達升高，並且過表達MEG3的胃癌細胞獲得了EMT表型特徵。這提示MEG3可能在胃癌EMT過程中發揮重要作用，但MEG3調控胃癌EMT的機制尚不清楚。本項目擬在前期工作基礎上，以胃癌細胞株、胃癌細胞及病人癌組織來源裸鼠移植瘤模型、胃癌組織為研究對象，通過基因晶片、ChIP等技術，觀察MEG3調控EMT對胃癌侵襲轉移的影響，闡明MEG3調控胃癌EMT的分子網路機制，探討MEG3與miRNAs的協調作用，為揭示胃癌侵襲轉移機理、開發基於RNA的新型分子靶向藥物提供理論依據。
結題摘要
胃癌是中國第二大常見惡性腫瘤，上皮間質轉化(EMT)是胃癌侵襲轉移研究的熱點。在前期工作中，我們發現lncRNA-MEG3在胃癌組織中表達下調，MEG3在TGF-β誘導後表達升高，並且過表達MEG3的胃癌細胞獲得了EMT表型特徵。本項目擬在前期工作基礎上闡明MEG3調控胃癌EMT的分子網路機制，探討MEG3與miRNAs的協調作用。本項目中，我們獲取胃癌及癌旁組織標本，利用基因晶片及生物信息學技術建立lncRNA以及circRNA差異表達譜，篩選出胃癌中表達差異顯著的lncRNA以及circRNA，其中顯著差異表達的lncRNA共1217條（上調751，下調466）；circRNA共49條（上調23，下調26）。MEG3在胃癌中顯著下調（FC=3.06, P=0.0275）。KEGG通路分析發現TGF-β通路是胃癌相關的重要信號通路，我們利用QSAR方法構建了TGF的DNA 和lncRNA MEG3 相互作用的分子模型，通過分子模擬評價兩者相互作用的親和力，發現了使MEG3 RNA與染色體的DNA結合形成RNA-DNA聯體結構發揮其功能。TGF-β信號通路中的一些基因確實可作為MEG3的目的基因，如：TGF-β2、TGF-βR-1和SMAD2等，並且在這些結合位點上也同樣含有豐富的GA序列。這說明GA序列引導了MEG3與目的基因的結合，從而形成RNA-DNA三聯體結構，導致TGF-β2、TGF-βR-1、SMAD2等基因表達下調，發揮其抑癌作用。還發現用於體外模擬靶向藥物瑞戈非尼如何作用於miR-21前體，從而阻斷成熟miR-21形成，目的是為開發胃癌靶向藥物提供一種新的研究方法和方向。在研究具體的生物lncRNA生物功能方面，我們發現LncRNA NNT-AS1在胃癌腫瘤組織中表達要高於正常組織，進一步進行靶基因研究，發現LncRNA NNT-AS1可以調控miR-424，進而影響轉錄因子E2F1的功能，從而促進胃癌的發生和細胞周期失調。本項目將為深入理解胃癌上皮間質轉化的機理、開發基於 RNA 的新型分子靶向藥物提供堅實基礎。
