鋅指結構蛋白通常由一系列鋅指組成。 具有重複結構的胺基酸模式,相隔特定距離的胱氨酸結合鋅指,能與某些RNA/DNA 結合。鋅指結構蛋白是一類對基因調控起重要的作用。根據其保守結構域的不同,可將鋅指結構蛋白主要分為C2H2型、C4型和C6型。
基本介紹
- 中文名:鋅指結構蛋白
- 所屬學科:分子生物學
鋅指結構蛋白通常由一系列鋅指組成。 具有重複結構的胺基酸模式,相隔特定距離的胱氨酸結合鋅指,能與某些RNA/DNA 結合。鋅指結構蛋白是一類對基因調控起重要的作用。根據其保守結構域的不同,可將鋅指結構蛋白主要分為C2H2型、C4型和C6型。
鋅指結構蛋白通常由一系列鋅指組成。 具有重複結構的胺基酸模式,相隔特定距離的胱氨酸結合鋅指,能與某些RNA/DNA 結合。鋅指結構蛋白是一類對基因調控起重要的作用。根據其保守結構域的不同,可將鋅指結構蛋白主要分為C2H2...
鋅指結構體指的是由一個含有大約30個胺基酸的環和一個與環上的4個Cys或2個Cys和2個His配位的Zn2+構成,形成的結構像手指狀。每個指含12~13個其他胺基酸。整個蛋白質分子可有2~9個這樣的鋅指重複單位。一個單位又以其指部伸入DNA雙螺旋的深溝,接觸5個核苷酸。此結構的功能就是為了適用於生物大分子之間相互...
鋅指分子是一種常出現在DNA結合蛋白質中的一種結構基元。鋅螯合在胺基酸鏈中形成鋅的指狀結構。鋅指指的是由一個含有大約30個胺基酸的環和一個與環上的4個Cys或2個Cys和2個His配位的Zn2+構成,形成的結構像手指狀。此結構的功能就是為了適用於生物大分子之間相互結合或吻合的蛋白分子上局部結構形式。鋅是某些酶...
蛋白質模體指的是由2個或3個具有二級結構的肽段,在空間上相互接近,形成一個特殊的空間結構。它具有特徵性的胺基酸排列順序,並且同特定的功能相聯繫。蛋白質分子中由胺基酸殘基空間排布形成具有特定生物學功能的結構模式。鋅指結構由1個a螺旋和1對反向β摺疊組成,形似手指,具有結合鋅離子的功能。在多數鋅指的兩端...
研究表明,許多鋅指蛋白在正常造血調控和血液系統惡性腫瘤中都起著重要作用。我們從人類CD34+造血乾/祖細胞中克隆到了一個新的鋅指基因makorin-2,其蛋白結構具有3個C3H鋅指和一個C3HC4環狀鋅指,提示其參與了蛋白-蛋白相互作用及蛋白質泛素或sumo化修飾; Northern blot分析表明其在各造血相關細胞系中...
鋅指蛋白是哺乳動物最大的轉錄調控因子家族,近年研究發現鋅指蛋白在腫瘤形成、生長以及轉移中起著重要作用。但對於人類基因組中存在的如此大量的鋅指蛋白,它們每種具體的生物學功能仍知之甚少。高通量分析顯示編碼KRAB型鋅指蛋白的ZNF75D和具有PR/SET結構域的鋅指蛋白ZNF298(PRDM15)在乳腺癌組織中...
本實驗室從水稻中鑑定了一個新的含有A20和AN1鋅指結構的鋅指蛋白家族AACZ家族。在動物中的同源基因AWP1的研究表明AACZ家族可能與細胞凋亡有關。mRNA表達分析表明水稻OsAACZ1為組成型表達,受低溫脅迫和熱脅迫的誘導但與高鹽、乾旱和ABA誘導無關,在酵母細胞中的表達表明OsAACZ1能夠顯著提高酵母細胞對熱激的耐受性,促...
鋅指蛋白265(Zinc finger protein 265, ZNF265)是含兩個鋅指結構及具有絲氨酸/精氨酸富集區的鋅指蛋白[3],目前研究主要認為它具有RNA結合功能,和轉錄、前體mRNA剪下相關[4,5]。我們在前期的研究中發現,ZNF265在大鼠Sertoli細胞中特異性高表達,且表達量和感染密切相關[6];而Sertoli細胞可以通過改變IL-1、IL-6...
通過酵母篩庫的方法,找到了SDG725的結合蛋白OsSUF4,該蛋白是具有鋅指蛋白結構域的轉錄因子,體外pull-down和體內的酵母雙雜交實驗和BiFC實驗都證實,SDG725的C末端與SUF4相互作用,進一步的實驗證明,OsSUF4是通過C末端與SDG725的C端結合。我們獲得了SUF4RNAi的不同的轉基因水稻株系,這些轉基因水稻都表現出晚花的...
《研究鋅指蛋白與核酸作用的篩選模型的建立及套用》是依託中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院,由趙志虎擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 蛋白與核酸相互作用,是基因表達調節最常用最有效的一種方式,鋅指是識別核酸最成功的一種結構元件。我們希望利用轉錄干擾、翻譯抑制現象,建立體內遺傳篩選模型,對經典鋅指的...
OsAACZ1是本實驗室鑑定的水稻鋅指蛋白基因,其在菸草中的表達能夠提高轉基因植株的耐冷、耐熱性,但增加了轉基因植株的乾旱和鹽敏感性。酵母雙雜交和體外Pull-Down試驗結果表明,OsAACZ1能夠與多聚泛素AIP1以及AIP2互作,且互作依賴於OsAACZ1蛋白結構中的A20結構域。OsAACZ1定位於細胞質,不具有轉錄激活活性...
課題組在前期研究中,經突變體庫篩選和基因tagging證實,球孢白僵菌中一個具鋅指結構的轉錄因子Bbazf負調控卵孢素的生物合成。敲除該基因,卵孢素合成顯著提高,菌株毒力增強。在此基礎上,本申請擬對Bbazf敲除子和野生型菌株進行轉錄組測序比較,獲得該基因調控的下游基因;利用酵母雙雜交和CHIP手段,分析與Bbazf相互...
此外,還對OsSZP的5個同亞家族基因功能進行了初步分析,結果表明這些鋅指蛋白與水稻根系、維管結構發育、育性及抗病性有關。已獲得OsSZP基因可變剪接轉錄本過表達轉基因株系,表型顯示其可變剪接與育性調控有關。同時,利用菸草瞬時表達系統建立了植物基因可變剪接快速、靈敏檢測體系,並對短重複序列介導可變剪接機制...
人染色體端粒末端的[TTAGGG]n重複DNA序列是基因組中重要的微衛星家族之一,影響著染色體的結構、基因的轉錄與翻譯等過程,與多種癌症相關。因此,獲得能與[TTAGGG]n特異性結合的分子是治療腫瘤的一種有效途徑。鋅指蛋白是人體內一類重要的功能蛋白,通過與 DNA結合而參與調控眾多生理過程,其中的C2H2型鋅指結構域結構上...
⑵ 採用反向遺傳學方法確認OsDHHC1和其它DHHC型鋅指蛋白基因在水稻分櫱調控中的功能。⑶ 了解OsDHHC1和其它DHHC型鋅指蛋白的蛋白質結構、S-醯基轉移酶活性與功能的關係。⑷ 解析OsDHHC1和其它DHHC型鋅指蛋白基因在環境因子和激素對水稻株型構建調控途徑中的位置及其調控分子機制。該項目的研究結果將為水稻理想株型塑造...
這類Cys₂/His₂鋅指單位的共有序列(consensus sequence)是:Cys - X - Cys - X₃ - Leu - X₂ - His - X₃ - His。哺乳類轉錄因子 SP1 也有類似的鋅指結構,由三個鋅指單位組成。另一類鋅指蛋白含兩對半胱氨酸,而不含組氨酸,如哺乳類細胞的甾體類激素受體蛋白。這類Cys₂/Cys₂鋅指單位...
Hedgehog是一種共價結合膽固醇的分泌性蛋白,在動物發育中起重要作用。兩個跨膜蛋白Patched(Ptc)和Smoothened(Smo)介導Hedgehog信號向胞內傳遞。Hedgehog信號途徑的轉錄因子是Ci(Cubitus interruptus,在脊椎動物中為Gli),具有鋅指結構,分子量155KD。基本信息 Hedgehog是一種共價結合膽固醇的分泌性蛋白,在動物發育中...
CtIP是一種含有 C2H2鋅指結構的轉錄因子。人類 ctip 基因,又稱為 RBBP8(retinoblastoma-binding protein 8),定位於 18 號染色體長臂 11.2 上(18q11.2)。其編碼的 CtIP 蛋白是一個由 897 個胺基酸組成的核蛋白,分子質量大小為 125kD。所有高等真核生物的 CtIP 蛋白分為 3 個大的功能域:N 端區域(...
Ikaros家族包括Ikaros , Aiolos , Helios , Eos和Pegasus五個成員,它們具有許多共同的特徵:①均在淋巴細胞中表達。②胺基酸序列兩端均有特徵鋅指蛋白結構域:C端的兩個鋅指結構介導Ikaros家族蛋白的自身聯繫,N端的鋅指蛋白結構具有DNA結合活性。Ikaros家族成員之間可通過C端的鋅指蛋白結構形成同源或異源二聚體,協同...
為深入研究鋅指蛋白識別結合DNAR的分子作用機制奠定了基礎。猴MTI基因的成功構建與表達,使獲取高純度的MTI重組蛋白成為了可能,這是高水平研究MT的前提,蛋白定點突變研究以及GSSG/GSH氧化還原對的相互作用研究,為最終闡明MT的結構——性質——反應——功能的關係提供了理論基礎。
類型:αα、ββ、αβα、鋅指結構、亮氨酸拉鏈 在反式作用因子的結構中,基序一般指構成任何一種特徵序列的基本結構,作為結構域中的亞單元,其功能是體現結構域的多種生物學作用。基元的基序 反式作用因子的DNA結合結構域(DNA binding domain)中的幾種常見基序:①螺旋/轉角/螺旋(Helix-turn-helix,HTH)基序...